Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COL9A2Q14055 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COL9A2Q14055 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COL9A2Q14055 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COL9A2Q14055 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COL9A2Q14055 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
COL9A2Q14055 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COL9A2Q14055 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
COL9A2Q14055 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
COL9A2Q14055 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
COL9A2Q14055 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
COL9A2Q14055 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
COL9A2Q14055 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
COL9A2Q14055 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
COL9A2Q14055 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
COL9A2Q14055 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
COL9A2Q14055 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
COL9A2Q14055 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
COL9A2Q14055 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
COL9A2Q14055 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
COL9A2Q14055 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
COL9A2Q14055 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
COL9A2Q14055 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
COL9A2Q14055 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
COL9A2Q14055 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
COL9A2Q14055 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
COL9A2Q14055 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
COL9A2Q14055 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
COL9A2Q14055 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
COL9A2Q14055 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
COL9A2Q14055 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
COL9A2Q14055 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
COL9A2Q14055 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
COL9A2Q14055 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COL9A2Q14055 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COL9A2Q14055 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
COL9A2Q14055 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
COL9A2Q14055 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
COL9A2Q14055 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
COL9A2Q14055 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
COL9A2Q14055 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COL9A2Q14055 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COL9A2Q14055 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
COL9A2Q14055 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
COL9A2Q14055 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
COL9A2Q14055 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
COL9A2Q14055 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
COL9A2Q14055 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
COL9A2Q14055 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
COL9A2Q14055 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
COL9A2Q14055 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
COL9A2Q14055 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
COL9A2Q14055 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
COL9A2Q14055 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COL9A2Q14055 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
COL9A2Q14055 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
COL9A2Q14055 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
COL9A2Q14055 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COL9A2Q14055 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COL9A2Q14055 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COL9A2Q14055 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COL9A2Q14055 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COL9A2Q14055 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COL9A2Q14055 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
COL9A2Q14055 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
COL9A2Q14055 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COL9A2Q14055 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COL9A2Q14055 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COL9A2Q14055 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COL9A2Q14055 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COL9A2Q14055 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
COL9A2Q14055 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COL9A2Q14055 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
COL9A2Q14055 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COL9A2Q14055 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
COL9A2Q14055 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
COL9A2Q14055 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
COL9A2Q14055 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COL9A2Q14055 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
COL9A2Q14055 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
COL9A2Q14055 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
COL9A2Q14055 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
COL9A2Q14055 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
COL9A2Q14055 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
COL9A2Q14055 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
COL9A2Q14055 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
COL9A2Q14055 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COL9A2Q14055 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COL9A2Q14055 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
COL9A2Q14055 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COL9A2Q14055 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COL9A2Q14055 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COL9A2Q14055 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
COL9A2Q14055 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COL9A2Q14055 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
COL9A2Q14055 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
COL9A2Q14055 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COL9A2Q14055 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COL9A2Q14055 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
COL9A2Q14055 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
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