Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NAE1Q13564 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NAE1Q13564 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NAE1Q13564 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NAE1Q13564 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NAE1Q13564 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NAE1Q13564 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NAE1Q13564 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NAE1Q13564 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NAE1Q13564 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NAE1Q13564 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NAE1Q13564 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NAE1Q13564 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NAE1Q13564 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NAE1Q13564 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NAE1Q13564 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NAE1Q13564 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NAE1Q13564 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NAE1Q13564 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NAE1Q13564 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NAE1Q13564 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NAE1Q13564 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NAE1Q13564 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NAE1Q13564 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NAE1Q13564 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NAE1Q13564 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NAE1Q13564 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NAE1Q13564 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NAE1Q13564 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NAE1Q13564 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NAE1Q13564 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NAE1Q13564 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NAE1Q13564 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NAE1Q13564 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NAE1Q13564 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NAE1Q13564 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NAE1Q13564 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NAE1Q13564 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NAE1Q13564 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
NAE1Q13564 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NAE1Q13564 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NAE1Q13564 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NAE1Q13564 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NAE1Q13564 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NAE1Q13564 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NAE1Q13564 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NAE1Q13564 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NAE1Q13564 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NAE1Q13564 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NAE1Q13564 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NAE1Q13564 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NAE1Q13564 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NAE1Q13564 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NAE1Q13564 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NAE1Q13564 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NAE1Q13564 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NAE1Q13564 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NAE1Q13564 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NAE1Q13564 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NAE1Q13564 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NAE1Q13564 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NAE1Q13564 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NAE1Q13564 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NAE1Q13564 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NAE1Q13564 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NAE1Q13564 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NAE1Q13564 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NAE1Q13564 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NAE1Q13564 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NAE1Q13564 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NAE1Q13564 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NAE1Q13564 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NAE1Q13564 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NAE1Q13564 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NAE1Q13564 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NAE1Q13564 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NAE1Q13564 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NAE1Q13564 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NAE1Q13564 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NAE1Q13564 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NAE1Q13564 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NAE1Q13564 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NAE1Q13564 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NAE1Q13564 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NAE1Q13564 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NAE1Q13564 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NAE1Q13564 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NAE1Q13564 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NAE1Q13564 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NAE1Q13564 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NAE1Q13564 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NAE1Q13564 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NAE1Q13564 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NAE1Q13564 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NAE1Q13564 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NAE1Q13564 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NAE1Q13564 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NAE1Q13564 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NAE1Q13564 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NAE1Q13564 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms