Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NAE1Q13564 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NAE1Q13564 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NAE1Q13564 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NAE1Q13564 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NAE1Q13564 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NAE1Q13564 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NAE1Q13564 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NAE1Q13564 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NAE1Q13564 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NAE1Q13564 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NAE1Q13564 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NAE1Q13564 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NAE1Q13564 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NAE1Q13564 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NAE1Q13564 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NAE1Q13564 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NAE1Q13564 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NAE1Q13564 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NAE1Q13564 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NAE1Q13564 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NAE1Q13564 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NAE1Q13564 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NAE1Q13564 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NAE1Q13564 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NAE1Q13564 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NAE1Q13564 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NAE1Q13564 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NAE1Q13564 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NAE1Q13564 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NAE1Q13564 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NAE1Q13564 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NAE1Q13564 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NAE1Q13564 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NAE1Q13564 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NAE1Q13564 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NAE1Q13564 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NAE1Q13564 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NAE1Q13564 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
NAE1Q13564 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NAE1Q13564 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NAE1Q13564 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NAE1Q13564 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NAE1Q13564 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NAE1Q13564 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NAE1Q13564 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NAE1Q13564 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NAE1Q13564 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NAE1Q13564 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NAE1Q13564 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NAE1Q13564 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NAE1Q13564 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NAE1Q13564 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NAE1Q13564 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NAE1Q13564 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NAE1Q13564 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NAE1Q13564 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NAE1Q13564 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NAE1Q13564 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NAE1Q13564 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NAE1Q13564 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NAE1Q13564 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NAE1Q13564 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NAE1Q13564 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NAE1Q13564 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NAE1Q13564 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NAE1Q13564 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NAE1Q13564 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NAE1Q13564 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NAE1Q13564 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NAE1Q13564 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NAE1Q13564 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NAE1Q13564 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NAE1Q13564 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NAE1Q13564 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NAE1Q13564 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NAE1Q13564 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NAE1Q13564 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NAE1Q13564 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NAE1Q13564 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NAE1Q13564 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NAE1Q13564 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NAE1Q13564 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NAE1Q13564 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NAE1Q13564 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NAE1Q13564 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NAE1Q13564 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NAE1Q13564 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NAE1Q13564 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NAE1Q13564 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NAE1Q13564 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NAE1Q13564 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NAE1Q13564 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NAE1Q13564 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NAE1Q13564 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NAE1Q13564 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NAE1Q13564 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NAE1Q13564 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NAE1Q13564 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NAE1Q13564 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
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