Protein–RNA interactions for Protein: Q13554

CAMK2B, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2BQ13554 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAMK2BQ13554 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAMK2BQ13554 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAMK2BQ13554 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAMK2BQ13554 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAMK2BQ13554 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CAMK2BQ13554 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CAMK2BQ13554 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CAMK2BQ13554 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CAMK2BQ13554 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CAMK2BQ13554 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CAMK2BQ13554 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CAMK2BQ13554 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CAMK2BQ13554 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CAMK2BQ13554 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAMK2BQ13554 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAMK2BQ13554 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAMK2BQ13554 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CAMK2BQ13554 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CAMK2BQ13554 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CAMK2BQ13554 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAMK2BQ13554 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CAMK2BQ13554 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAMK2BQ13554 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAMK2BQ13554 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAMK2BQ13554 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAMK2BQ13554 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAMK2BQ13554 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CAMK2BQ13554 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAMK2BQ13554 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAMK2BQ13554 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CAMK2BQ13554 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAMK2BQ13554 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAMK2BQ13554 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CAMK2BQ13554 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAMK2BQ13554 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAMK2BQ13554 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CAMK2BQ13554 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAMK2BQ13554 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAMK2BQ13554 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAMK2BQ13554 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAMK2BQ13554 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CAMK2BQ13554 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAMK2BQ13554 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAMK2BQ13554 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAMK2BQ13554 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CAMK2BQ13554 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CAMK2BQ13554 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CAMK2BQ13554 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAMK2BQ13554 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAMK2BQ13554 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAMK2BQ13554 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAMK2BQ13554 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAMK2BQ13554 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CAMK2BQ13554 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAMK2BQ13554 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAMK2BQ13554 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAMK2BQ13554 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CAMK2BQ13554 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CAMK2BQ13554 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAMK2BQ13554 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CAMK2BQ13554 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAMK2BQ13554 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAMK2BQ13554 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAMK2BQ13554 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAMK2BQ13554 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CAMK2BQ13554 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAMK2BQ13554 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAMK2BQ13554 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAMK2BQ13554 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CAMK2BQ13554 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CAMK2BQ13554 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAMK2BQ13554 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CAMK2BQ13554 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAMK2BQ13554 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAMK2BQ13554 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CAMK2BQ13554 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CAMK2BQ13554 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAMK2BQ13554 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAMK2BQ13554 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAMK2BQ13554 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CAMK2BQ13554 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAMK2BQ13554 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAMK2BQ13554 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAMK2BQ13554 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAMK2BQ13554 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAMK2BQ13554 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAMK2BQ13554 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CAMK2BQ13554 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAMK2BQ13554 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAMK2BQ13554 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAMK2BQ13554 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAMK2BQ13554 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAMK2BQ13554 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CAMK2BQ13554 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CAMK2BQ13554 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAMK2BQ13554 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CAMK2BQ13554 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CAMK2BQ13554 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CAMK2BQ13554 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
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