Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SP140Q13342 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SP140Q13342 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SP140Q13342 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SP140Q13342 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SP140Q13342 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SP140Q13342 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SP140Q13342 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SP140Q13342 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SP140Q13342 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SP140Q13342 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SP140Q13342 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SP140Q13342 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SP140Q13342 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SP140Q13342 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SP140Q13342 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SP140Q13342 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SP140Q13342 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SP140Q13342 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SP140Q13342 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SP140Q13342 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SP140Q13342 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SP140Q13342 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SP140Q13342 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SP140Q13342 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SP140Q13342 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SP140Q13342 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SP140Q13342 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SP140Q13342 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SP140Q13342 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SP140Q13342 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SP140Q13342 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SP140Q13342 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SP140Q13342 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SP140Q13342 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SP140Q13342 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SP140Q13342 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SP140Q13342 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SP140Q13342 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SP140Q13342 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SP140Q13342 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SP140Q13342 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SP140Q13342 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SP140Q13342 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SP140Q13342 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SP140Q13342 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SP140Q13342 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SP140Q13342 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SP140Q13342 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SP140Q13342 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SP140Q13342 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SP140Q13342 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SP140Q13342 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SP140Q13342 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SP140Q13342 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SP140Q13342 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SP140Q13342 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SP140Q13342 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SP140Q13342 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SP140Q13342 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SP140Q13342 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SP140Q13342 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SP140Q13342 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SP140Q13342 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SP140Q13342 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SP140Q13342 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SP140Q13342 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SP140Q13342 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SP140Q13342 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SP140Q13342 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SP140Q13342 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SP140Q13342 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SP140Q13342 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SP140Q13342 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SP140Q13342 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SP140Q13342 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SP140Q13342 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SP140Q13342 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SP140Q13342 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SP140Q13342 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SP140Q13342 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SP140Q13342 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SP140Q13342 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SP140Q13342 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SP140Q13342 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SP140Q13342 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SP140Q13342 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SP140Q13342 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SP140Q13342 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SP140Q13342 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SP140Q13342 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SP140Q13342 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SP140Q13342 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SP140Q13342 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SP140Q13342 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SP140Q13342 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SP140Q13342 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SP140Q13342 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SP140Q13342 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SP140Q13342 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms