Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SRSF6Q13247 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SRSF6Q13247 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SRSF6Q13247 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRSF6Q13247 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRSF6Q13247 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRSF6Q13247 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRSF6Q13247 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRSF6Q13247 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SRSF6Q13247 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SRSF6Q13247 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRSF6Q13247 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRSF6Q13247 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRSF6Q13247 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SRSF6Q13247 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRSF6Q13247 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRSF6Q13247 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRSF6Q13247 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRSF6Q13247 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRSF6Q13247 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRSF6Q13247 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRSF6Q13247 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRSF6Q13247 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRSF6Q13247 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRSF6Q13247 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRSF6Q13247 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRSF6Q13247 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRSF6Q13247 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRSF6Q13247 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRSF6Q13247 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRSF6Q13247 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRSF6Q13247 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRSF6Q13247 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRSF6Q13247 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SRSF6Q13247 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SRSF6Q13247 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRSF6Q13247 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRSF6Q13247 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SRSF6Q13247 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRSF6Q13247 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SRSF6Q13247 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SRSF6Q13247 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRSF6Q13247 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRSF6Q13247 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRSF6Q13247 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRSF6Q13247 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRSF6Q13247 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRSF6Q13247 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRSF6Q13247 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SRSF6Q13247 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRSF6Q13247 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRSF6Q13247 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRSF6Q13247 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SRSF6Q13247 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SRSF6Q13247 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SRSF6Q13247 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SRSF6Q13247 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SRSF6Q13247 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SRSF6Q13247 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SRSF6Q13247 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SRSF6Q13247 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SRSF6Q13247 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SRSF6Q13247 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SRSF6Q13247 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SRSF6Q13247 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SRSF6Q13247 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SRSF6Q13247 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SRSF6Q13247 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SRSF6Q13247 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SRSF6Q13247 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SRSF6Q13247 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRSF6Q13247 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRSF6Q13247 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRSF6Q13247 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SRSF6Q13247 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SRSF6Q13247 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SRSF6Q13247 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SRSF6Q13247 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRSF6Q13247 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRSF6Q13247 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRSF6Q13247 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRSF6Q13247 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRSF6Q13247 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRSF6Q13247 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRSF6Q13247 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRSF6Q13247 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRSF6Q13247 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRSF6Q13247 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRSF6Q13247 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRSF6Q13247 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRSF6Q13247 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRSF6Q13247 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRSF6Q13247 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRSF6Q13247 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRSF6Q13247 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRSF6Q13247 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRSF6Q13247 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRSF6Q13247 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRSF6Q13247 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRSF6Q13247 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
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