Protein–RNA interactions for Protein: Q13136

PPFIA1, Liprin-alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA1Q13136 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PPFIA1Q13136 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PPFIA1Q13136 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PPFIA1Q13136 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PPFIA1Q13136 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
PPFIA1Q13136 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PPFIA1Q13136 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PPFIA1Q13136 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PPFIA1Q13136 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PPFIA1Q13136 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PPFIA1Q13136 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PPFIA1Q13136 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PPFIA1Q13136 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PPFIA1Q13136 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
PPFIA1Q13136 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PPFIA1Q13136 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
PPFIA1Q13136 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PPFIA1Q13136 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PPFIA1Q13136 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PPFIA1Q13136 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PPFIA1Q13136 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PPFIA1Q13136 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PPFIA1Q13136 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PPFIA1Q13136 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PPFIA1Q13136 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PPFIA1Q13136 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PPFIA1Q13136 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PPFIA1Q13136 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PPFIA1Q13136 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
PPFIA1Q13136 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PPFIA1Q13136 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PPFIA1Q13136 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PPFIA1Q13136 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PPFIA1Q13136 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PPFIA1Q13136 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PPFIA1Q13136 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PPFIA1Q13136 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PPFIA1Q13136 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PPFIA1Q13136 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PPFIA1Q13136 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PPFIA1Q13136 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PPFIA1Q13136 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PPFIA1Q13136 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PPFIA1Q13136 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PPFIA1Q13136 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PPFIA1Q13136 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PPFIA1Q13136 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PPFIA1Q13136 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PPFIA1Q13136 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PPFIA1Q13136 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PPFIA1Q13136 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PPFIA1Q13136 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PPFIA1Q13136 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PPFIA1Q13136 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PPFIA1Q13136 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PPFIA1Q13136 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PPFIA1Q13136 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PPFIA1Q13136 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PPFIA1Q13136 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PPFIA1Q13136 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PPFIA1Q13136 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PPFIA1Q13136 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PPFIA1Q13136 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PPFIA1Q13136 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PPFIA1Q13136 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PPFIA1Q13136 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PPFIA1Q13136 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PPFIA1Q13136 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PPFIA1Q13136 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PPFIA1Q13136 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PPFIA1Q13136 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PPFIA1Q13136 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PPFIA1Q13136 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PPFIA1Q13136 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PPFIA1Q13136 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PPFIA1Q13136 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PPFIA1Q13136 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PPFIA1Q13136 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PPFIA1Q13136 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PPFIA1Q13136 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PPFIA1Q13136 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PPFIA1Q13136 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PPFIA1Q13136 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PPFIA1Q13136 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PPFIA1Q13136 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PPFIA1Q13136 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PPFIA1Q13136 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PPFIA1Q13136 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
PPFIA1Q13136 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
PPFIA1Q13136 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PPFIA1Q13136 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PPFIA1Q13136 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PPFIA1Q13136 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PPFIA1Q13136 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PPFIA1Q13136 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PPFIA1Q13136 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PPFIA1Q13136 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PPFIA1Q13136 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PPFIA1Q13136 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PPFIA1Q13136 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
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