Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPS1Q13098 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPS1Q13098 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPS1Q13098 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GPS1Q13098 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GPS1Q13098 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GPS1Q13098 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GPS1Q13098 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPS1Q13098 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPS1Q13098 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPS1Q13098 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GPS1Q13098 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPS1Q13098 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPS1Q13098 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GPS1Q13098 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GPS1Q13098 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GPS1Q13098 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GPS1Q13098 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GPS1Q13098 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GPS1Q13098 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPS1Q13098 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPS1Q13098 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPS1Q13098 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPS1Q13098 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPS1Q13098 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPS1Q13098 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
GPS1Q13098 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
GPS1Q13098 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
GPS1Q13098 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
GPS1Q13098 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
GPS1Q13098 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
GPS1Q13098 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
GPS1Q13098 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
GPS1Q13098 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
GPS1Q13098 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPS1Q13098 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPS1Q13098 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GPS1Q13098 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPS1Q13098 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPS1Q13098 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPS1Q13098 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPS1Q13098 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPS1Q13098 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPS1Q13098 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
GPS1Q13098 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GPS1Q13098 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPS1Q13098 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPS1Q13098 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPS1Q13098 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPS1Q13098 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPS1Q13098 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GPS1Q13098 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GPS1Q13098 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GPS1Q13098 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GPS1Q13098 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GPS1Q13098 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GPS1Q13098 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GPS1Q13098 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GPS1Q13098 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GPS1Q13098 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GPS1Q13098 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GPS1Q13098 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPS1Q13098 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPS1Q13098 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPS1Q13098 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPS1Q13098 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GPS1Q13098 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GPS1Q13098 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
GPS1Q13098 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GPS1Q13098 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
GPS1Q13098 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GPS1Q13098 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
GPS1Q13098 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GPS1Q13098 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GPS1Q13098 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GPS1Q13098 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GPS1Q13098 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GPS1Q13098 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
GPS1Q13098 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
GPS1Q13098 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
GPS1Q13098 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GPS1Q13098 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GPS1Q13098 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
GPS1Q13098 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GPS1Q13098 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GPS1Q13098 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GPS1Q13098 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GPS1Q13098 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GPS1Q13098 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GPS1Q13098 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GPS1Q13098 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GPS1Q13098 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GPS1Q13098 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GPS1Q13098 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GPS1Q13098 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GPS1Q13098 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GPS1Q13098 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GPS1Q13098 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GPS1Q13098 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GPS1Q13098 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
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