Protein–RNA interactions for Protein: Q13094

LCP2, Lymphocyte cytosolic protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCP2Q13094 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LCP2Q13094 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LCP2Q13094 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LCP2Q13094 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LCP2Q13094 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LCP2Q13094 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LCP2Q13094 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LCP2Q13094 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LCP2Q13094 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LCP2Q13094 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LCP2Q13094 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LCP2Q13094 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LCP2Q13094 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LCP2Q13094 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LCP2Q13094 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LCP2Q13094 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LCP2Q13094 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LCP2Q13094 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LCP2Q13094 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LCP2Q13094 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
LCP2Q13094 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
LCP2Q13094 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
LCP2Q13094 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LCP2Q13094 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LCP2Q13094 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LCP2Q13094 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LCP2Q13094 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LCP2Q13094 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LCP2Q13094 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LCP2Q13094 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LCP2Q13094 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LCP2Q13094 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LCP2Q13094 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LCP2Q13094 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LCP2Q13094 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
LCP2Q13094 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LCP2Q13094 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LCP2Q13094 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LCP2Q13094 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
LCP2Q13094 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LCP2Q13094 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LCP2Q13094 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LCP2Q13094 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LCP2Q13094 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LCP2Q13094 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LCP2Q13094 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LCP2Q13094 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LCP2Q13094 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LCP2Q13094 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LCP2Q13094 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LCP2Q13094 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LCP2Q13094 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LCP2Q13094 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LCP2Q13094 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LCP2Q13094 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LCP2Q13094 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LCP2Q13094 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LCP2Q13094 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LCP2Q13094 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LCP2Q13094 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
LCP2Q13094 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LCP2Q13094 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LCP2Q13094 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LCP2Q13094 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LCP2Q13094 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LCP2Q13094 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LCP2Q13094 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LCP2Q13094 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LCP2Q13094 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
LCP2Q13094 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LCP2Q13094 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LCP2Q13094 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LCP2Q13094 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LCP2Q13094 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LCP2Q13094 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LCP2Q13094 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LCP2Q13094 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LCP2Q13094 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LCP2Q13094 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LCP2Q13094 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LCP2Q13094 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
LCP2Q13094 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LCP2Q13094 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LCP2Q13094 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LCP2Q13094 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LCP2Q13094 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LCP2Q13094 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LCP2Q13094 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LCP2Q13094 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LCP2Q13094 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LCP2Q13094 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LCP2Q13094 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LCP2Q13094 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LCP2Q13094 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LCP2Q13094 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LCP2Q13094 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LCP2Q13094 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LCP2Q13094 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LCP2Q13094 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LCP2Q13094 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 176.8 ms