Protein–RNA interactions for Protein: Q12872

SFSWAP, Splicing factor, suppressor of white-apricot homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 951 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFSWAPQ12872 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SFSWAPQ12872 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SFSWAPQ12872 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SFSWAPQ12872 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SFSWAPQ12872 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SFSWAPQ12872 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SFSWAPQ12872 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SFSWAPQ12872 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SFSWAPQ12872 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SFSWAPQ12872 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SFSWAPQ12872 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SFSWAPQ12872 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SFSWAPQ12872 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SFSWAPQ12872 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SFSWAPQ12872 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SFSWAPQ12872 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SFSWAPQ12872 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SFSWAPQ12872 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SFSWAPQ12872 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SFSWAPQ12872 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SFSWAPQ12872 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SFSWAPQ12872 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SFSWAPQ12872 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SFSWAPQ12872 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SFSWAPQ12872 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SFSWAPQ12872 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SFSWAPQ12872 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SFSWAPQ12872 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SFSWAPQ12872 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SFSWAPQ12872 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SFSWAPQ12872 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SFSWAPQ12872 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SFSWAPQ12872 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SFSWAPQ12872 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SFSWAPQ12872 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SFSWAPQ12872 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SFSWAPQ12872 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SFSWAPQ12872 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SFSWAPQ12872 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SFSWAPQ12872 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SFSWAPQ12872 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SFSWAPQ12872 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SFSWAPQ12872 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SFSWAPQ12872 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SFSWAPQ12872 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SFSWAPQ12872 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SFSWAPQ12872 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SFSWAPQ12872 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SFSWAPQ12872 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SFSWAPQ12872 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SFSWAPQ12872 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SFSWAPQ12872 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SFSWAPQ12872 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SFSWAPQ12872 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SFSWAPQ12872 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SFSWAPQ12872 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SFSWAPQ12872 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SFSWAPQ12872 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SFSWAPQ12872 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SFSWAPQ12872 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SFSWAPQ12872 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SFSWAPQ12872 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SFSWAPQ12872 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SFSWAPQ12872 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SFSWAPQ12872 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SFSWAPQ12872 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SFSWAPQ12872 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SFSWAPQ12872 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SFSWAPQ12872 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SFSWAPQ12872 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SFSWAPQ12872 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SFSWAPQ12872 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SFSWAPQ12872 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SFSWAPQ12872 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SFSWAPQ12872 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SFSWAPQ12872 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SFSWAPQ12872 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SFSWAPQ12872 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SFSWAPQ12872 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SFSWAPQ12872 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SFSWAPQ12872 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SFSWAPQ12872 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SFSWAPQ12872 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SFSWAPQ12872 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SFSWAPQ12872 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SFSWAPQ12872 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SFSWAPQ12872 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SFSWAPQ12872 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SFSWAPQ12872 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SFSWAPQ12872 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SFSWAPQ12872 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SFSWAPQ12872 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SFSWAPQ12872 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SFSWAPQ12872 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SFSWAPQ12872 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SFSWAPQ12872 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SFSWAPQ12872 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SFSWAPQ12872 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SFSWAPQ12872 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SFSWAPQ12872 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
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