Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDE4CQ08493 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDE4CQ08493 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDE4CQ08493 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PDE4CQ08493 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDE4CQ08493 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PDE4CQ08493 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDE4CQ08493 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDE4CQ08493 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDE4CQ08493 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PDE4CQ08493 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDE4CQ08493 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDE4CQ08493 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDE4CQ08493 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDE4CQ08493 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDE4CQ08493 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDE4CQ08493 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PDE4CQ08493 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PDE4CQ08493 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PDE4CQ08493 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PDE4CQ08493 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PDE4CQ08493 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PDE4CQ08493 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PDE4CQ08493 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PDE4CQ08493 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PDE4CQ08493 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PDE4CQ08493 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
PDE4CQ08493 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
PDE4CQ08493 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDE4CQ08493 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDE4CQ08493 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDE4CQ08493 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDE4CQ08493 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PDE4CQ08493 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PDE4CQ08493 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PDE4CQ08493 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDE4CQ08493 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PDE4CQ08493 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDE4CQ08493 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDE4CQ08493 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PDE4CQ08493 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDE4CQ08493 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDE4CQ08493 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDE4CQ08493 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDE4CQ08493 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDE4CQ08493 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDE4CQ08493 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDE4CQ08493 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDE4CQ08493 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDE4CQ08493 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDE4CQ08493 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDE4CQ08493 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDE4CQ08493 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDE4CQ08493 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDE4CQ08493 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PDE4CQ08493 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDE4CQ08493 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDE4CQ08493 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDE4CQ08493 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDE4CQ08493 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PDE4CQ08493 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDE4CQ08493 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDE4CQ08493 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDE4CQ08493 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDE4CQ08493 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDE4CQ08493 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDE4CQ08493 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDE4CQ08493 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PDE4CQ08493 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDE4CQ08493 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDE4CQ08493 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDE4CQ08493 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDE4CQ08493 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PDE4CQ08493 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDE4CQ08493 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDE4CQ08493 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDE4CQ08493 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PDE4CQ08493 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDE4CQ08493 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDE4CQ08493 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDE4CQ08493 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDE4CQ08493 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PDE4CQ08493 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDE4CQ08493 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDE4CQ08493 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDE4CQ08493 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDE4CQ08493 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDE4CQ08493 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDE4CQ08493 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDE4CQ08493 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDE4CQ08493 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDE4CQ08493 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDE4CQ08493 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PDE4CQ08493 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDE4CQ08493 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDE4CQ08493 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDE4CQ08493 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDE4CQ08493 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PDE4CQ08493 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PDE4CQ08493 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms