Protein–RNA interactions for Protein: Q08211

DHX9, ATP-dependent RNA helicase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX9Q08211 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DHX9Q08211 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DHX9Q08211 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DHX9Q08211 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
DHX9Q08211 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DHX9Q08211 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DHX9Q08211 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DHX9Q08211 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DHX9Q08211 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DHX9Q08211 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DHX9Q08211 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DHX9Q08211 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DHX9Q08211 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DHX9Q08211 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DHX9Q08211 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DHX9Q08211 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DHX9Q08211 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DHX9Q08211 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DHX9Q08211 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DHX9Q08211 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DHX9Q08211 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
DHX9Q08211 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DHX9Q08211 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DHX9Q08211 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DHX9Q08211 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DHX9Q08211 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DHX9Q08211 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DHX9Q08211 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DHX9Q08211 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DHX9Q08211 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
DHX9Q08211 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DHX9Q08211 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DHX9Q08211 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DHX9Q08211 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DHX9Q08211 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DHX9Q08211 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DHX9Q08211 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DHX9Q08211 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DHX9Q08211 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DHX9Q08211 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DHX9Q08211 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DHX9Q08211 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DHX9Q08211 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DHX9Q08211 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DHX9Q08211 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DHX9Q08211 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DHX9Q08211 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DHX9Q08211 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DHX9Q08211 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DHX9Q08211 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DHX9Q08211 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DHX9Q08211 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DHX9Q08211 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DHX9Q08211 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DHX9Q08211 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DHX9Q08211 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DHX9Q08211 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DHX9Q08211 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DHX9Q08211 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DHX9Q08211 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DHX9Q08211 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DHX9Q08211 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DHX9Q08211 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DHX9Q08211 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
DHX9Q08211 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
DHX9Q08211 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
DHX9Q08211 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DHX9Q08211 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DHX9Q08211 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DHX9Q08211 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DHX9Q08211 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DHX9Q08211 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DHX9Q08211 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DHX9Q08211 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
DHX9Q08211 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DHX9Q08211 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DHX9Q08211 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DHX9Q08211 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DHX9Q08211 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DHX9Q08211 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DHX9Q08211 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DHX9Q08211 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DHX9Q08211 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
DHX9Q08211 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DHX9Q08211 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
DHX9Q08211 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DHX9Q08211 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DHX9Q08211 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DHX9Q08211 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DHX9Q08211 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DHX9Q08211 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DHX9Q08211 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DHX9Q08211 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DHX9Q08211 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DHX9Q08211 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DHX9Q08211 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DHX9Q08211 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DHX9Q08211 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DHX9Q08211 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
DHX9Q08211 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms