Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHRNB3Q05901 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHRNB3Q05901 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHRNB3Q05901 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHRNB3Q05901 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHRNB3Q05901 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHRNB3Q05901 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHRNB3Q05901 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CHRNB3Q05901 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHRNB3Q05901 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHRNB3Q05901 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHRNB3Q05901 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHRNB3Q05901 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CHRNB3Q05901 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHRNB3Q05901 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHRNB3Q05901 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHRNB3Q05901 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHRNB3Q05901 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHRNB3Q05901 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHRNB3Q05901 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHRNB3Q05901 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHRNB3Q05901 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHRNB3Q05901 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHRNB3Q05901 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHRNB3Q05901 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CHRNB3Q05901 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHRNB3Q05901 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CHRNB3Q05901 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CHRNB3Q05901 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHRNB3Q05901 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CHRNB3Q05901 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHRNB3Q05901 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CHRNB3Q05901 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHRNB3Q05901 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHRNB3Q05901 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CHRNB3Q05901 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CHRNB3Q05901 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNB3Q05901 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNB3Q05901 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNB3Q05901 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CHRNB3Q05901 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CHRNB3Q05901 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CHRNB3Q05901 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNB3Q05901 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNB3Q05901 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CHRNB3Q05901 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNB3Q05901 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNB3Q05901 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNB3Q05901 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CHRNB3Q05901 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNB3Q05901 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNB3Q05901 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNB3Q05901 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNB3Q05901 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNB3Q05901 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNB3Q05901 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CHRNB3Q05901 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNB3Q05901 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CHRNB3Q05901 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNB3Q05901 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNB3Q05901 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNB3Q05901 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNB3Q05901 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CHRNB3Q05901 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNB3Q05901 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNB3Q05901 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNB3Q05901 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNB3Q05901 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNB3Q05901 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CHRNB3Q05901 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHRNB3Q05901 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CHRNB3Q05901 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CHRNB3Q05901 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHRNB3Q05901 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHRNB3Q05901 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CHRNB3Q05901 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHRNB3Q05901 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CHRNB3Q05901 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNB3Q05901 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNB3Q05901 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNB3Q05901 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNB3Q05901 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNB3Q05901 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNB3Q05901 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNB3Q05901 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNB3Q05901 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CHRNB3Q05901 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNB3Q05901 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNB3Q05901 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNB3Q05901 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNB3Q05901 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNB3Q05901 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNB3Q05901 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CHRNB3Q05901 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNB3Q05901 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNB3Q05901 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CHRNB3Q05901 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNB3Q05901 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNB3Q05901 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CHRNB3Q05901 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 164.1 ms