Protein–RNA interactions for Protein: Q04759

PRKCQ, Protein kinase C theta type, humanhuman

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCQQ04759 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKCQQ04759 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKCQQ04759 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKCQQ04759 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKCQQ04759 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKCQQ04759 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKCQQ04759 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRKCQQ04759 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRKCQQ04759 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRKCQQ04759 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PRKCQQ04759 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRKCQQ04759 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRKCQQ04759 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRKCQQ04759 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRKCQQ04759 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRKCQQ04759 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRKCQQ04759 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PRKCQQ04759 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRKCQQ04759 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRKCQQ04759 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRKCQQ04759 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRKCQQ04759 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRKCQQ04759 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRKCQQ04759 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRKCQQ04759 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PRKCQQ04759 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRKCQQ04759 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRKCQQ04759 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRKCQQ04759 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRKCQQ04759 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRKCQQ04759 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PRKCQQ04759 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PRKCQQ04759 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRKCQQ04759 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRKCQQ04759 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PRKCQQ04759 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PRKCQQ04759 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRKCQQ04759 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRKCQQ04759 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRKCQQ04759 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRKCQQ04759 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PRKCQQ04759 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PRKCQQ04759 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRKCQQ04759 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRKCQQ04759 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRKCQQ04759 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRKCQQ04759 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRKCQQ04759 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRKCQQ04759 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRKCQQ04759 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRKCQQ04759 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRKCQQ04759 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRKCQQ04759 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKCQQ04759 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKCQQ04759 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKCQQ04759 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRKCQQ04759 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRKCQQ04759 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRKCQQ04759 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRKCQQ04759 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRKCQQ04759 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRKCQQ04759 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRKCQQ04759 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRKCQQ04759 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRKCQQ04759 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRKCQQ04759 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRKCQQ04759 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRKCQQ04759 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKCQQ04759 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKCQQ04759 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKCQQ04759 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKCQQ04759 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKCQQ04759 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKCQQ04759 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKCQQ04759 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRKCQQ04759 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRKCQQ04759 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRKCQQ04759 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRKCQQ04759 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRKCQQ04759 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRKCQQ04759 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKCQQ04759 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKCQQ04759 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKCQQ04759 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKCQQ04759 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKCQQ04759 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKCQQ04759 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKCQQ04759 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKCQQ04759 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKCQQ04759 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKCQQ04759 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKCQQ04759 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKCQQ04759 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRKCQQ04759 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRKCQQ04759 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRKCQQ04759 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRKCQQ04759 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PRKCQQ04759 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKCQQ04759 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PRKCQQ04759 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms