Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
ATP7AQ04656 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC37.29■■■■□ 3.56
ATP7AQ04656 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
ATP7AQ04656 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
ATP7AQ04656 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
ATP7AQ04656 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
ATP7AQ04656 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
ATP7AQ04656 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
ATP7AQ04656 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC37.27■■■■□ 3.56
ATP7AQ04656 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
ATP7AQ04656 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
ATP7AQ04656 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
ATP7AQ04656 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC37.26■■■■□ 3.55
ATP7AQ04656 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.55
ATP7AQ04656 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC37.25■■■■□ 3.55
ATP7AQ04656 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
ATP7AQ04656 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
ATP7AQ04656 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
ATP7AQ04656 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
ATP7AQ04656 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
ATP7AQ04656 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
ATP7AQ04656 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
ATP7AQ04656 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
ATP7AQ04656 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
ATP7AQ04656 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
ATP7AQ04656 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
ATP7AQ04656 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
ATP7AQ04656 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
ATP7AQ04656 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
ATP7AQ04656 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
ATP7AQ04656 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
ATP7AQ04656 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
ATP7AQ04656 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
ATP7AQ04656 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
ATP7AQ04656 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC37.19■■■■□ 3.54
ATP7AQ04656 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
ATP7AQ04656 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
ATP7AQ04656 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
ATP7AQ04656 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
ATP7AQ04656 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
ATP7AQ04656 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
ATP7AQ04656 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
ATP7AQ04656 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC37.17■■■■□ 3.54
ATP7AQ04656 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
ATP7AQ04656 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
ATP7AQ04656 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
ATP7AQ04656 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
ATP7AQ04656 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
ATP7AQ04656 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
ATP7AQ04656 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
ATP7AQ04656 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.54
ATP7AQ04656 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
ATP7AQ04656 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
ATP7AQ04656 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC37.13■■■■□ 3.53
ATP7AQ04656 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
ATP7AQ04656 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
ATP7AQ04656 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC37.12■■■■□ 3.53
ATP7AQ04656 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC37.12■■■■□ 3.53
ATP7AQ04656 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
ATP7AQ04656 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
ATP7AQ04656 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC37.11■■■■□ 3.53
ATP7AQ04656 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
ATP7AQ04656 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
ATP7AQ04656 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
ATP7AQ04656 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
ATP7AQ04656 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
ATP7AQ04656 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.1■■■■□ 3.53
ATP7AQ04656 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC37.1■■■■□ 3.53
ATP7AQ04656 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
ATP7AQ04656 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC37.09■■■■□ 3.53
ATP7AQ04656 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC37.09■■■■□ 3.53
ATP7AQ04656 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
ATP7AQ04656 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
ATP7AQ04656 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
ATP7AQ04656 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
ATP7AQ04656 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
ATP7AQ04656 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
ATP7AQ04656 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
ATP7AQ04656 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.53
ATP7AQ04656 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC37.07■■■■□ 3.53
ATP7AQ04656 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC37.07■■■■□ 3.52
ATP7AQ04656 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
ATP7AQ04656 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
ATP7AQ04656 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
ATP7AQ04656 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC37.06■■■■□ 3.52
ATP7AQ04656 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
ATP7AQ04656 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
ATP7AQ04656 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
ATP7AQ04656 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
ATP7AQ04656 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
ATP7AQ04656 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
ATP7AQ04656 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
ATP7AQ04656 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
ATP7AQ04656 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
ATP7AQ04656 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
ATP7AQ04656 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC37.04■■■■□ 3.52
ATP7AQ04656 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
ATP7AQ04656 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.04■■■■□ 3.52
ATP7AQ04656 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
ATP7AQ04656 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms