Protein–RNA interactions for Protein: Q03403

TFF2, Trefoil factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF2Q03403 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TFF2Q03403 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TFF2Q03403 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TFF2Q03403 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TFF2Q03403 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TFF2Q03403 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TFF2Q03403 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TFF2Q03403 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TFF2Q03403 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
TFF2Q03403 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TFF2Q03403 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TFF2Q03403 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TFF2Q03403 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TFF2Q03403 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TFF2Q03403 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TFF2Q03403 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TFF2Q03403 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TFF2Q03403 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TFF2Q03403 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TFF2Q03403 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
TFF2Q03403 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TFF2Q03403 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TFF2Q03403 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TFF2Q03403 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TFF2Q03403 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TFF2Q03403 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TFF2Q03403 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TFF2Q03403 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TFF2Q03403 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TFF2Q03403 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TFF2Q03403 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TFF2Q03403 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TFF2Q03403 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TFF2Q03403 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TFF2Q03403 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TFF2Q03403 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TFF2Q03403 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TFF2Q03403 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TFF2Q03403 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TFF2Q03403 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TFF2Q03403 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TFF2Q03403 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TFF2Q03403 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TFF2Q03403 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TFF2Q03403 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TFF2Q03403 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TFF2Q03403 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TFF2Q03403 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TFF2Q03403 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TFF2Q03403 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TFF2Q03403 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TFF2Q03403 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TFF2Q03403 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TFF2Q03403 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
TFF2Q03403 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TFF2Q03403 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TFF2Q03403 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TFF2Q03403 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TFF2Q03403 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TFF2Q03403 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TFF2Q03403 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TFF2Q03403 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TFF2Q03403 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TFF2Q03403 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TFF2Q03403 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TFF2Q03403 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TFF2Q03403 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TFF2Q03403 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TFF2Q03403 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TFF2Q03403 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TFF2Q03403 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TFF2Q03403 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TFF2Q03403 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TFF2Q03403 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TFF2Q03403 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TFF2Q03403 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TFF2Q03403 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TFF2Q03403 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TFF2Q03403 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TFF2Q03403 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TFF2Q03403 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TFF2Q03403 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TFF2Q03403 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TFF2Q03403 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TFF2Q03403 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TFF2Q03403 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TFF2Q03403 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TFF2Q03403 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TFF2Q03403 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TFF2Q03403 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TFF2Q03403 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TFF2Q03403 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TFF2Q03403 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TFF2Q03403 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TFF2Q03403 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TFF2Q03403 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TFF2Q03403 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TFF2Q03403 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TFF2Q03403 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TFF2Q03403 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms