Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.83■■■■■ 4.29
TOP2BQ02880 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
TOP2BQ02880 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC41.82■■■■■ 4.29
TOP2BQ02880 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
TOP2BQ02880 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
TOP2BQ02880 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
TOP2BQ02880 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
TOP2BQ02880 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
TOP2BQ02880 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC41.81■■■■■ 4.28
TOP2BQ02880 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC41.81■■■■■ 4.28
TOP2BQ02880 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
TOP2BQ02880 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
TOP2BQ02880 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
TOP2BQ02880 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
TOP2BQ02880 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
TOP2BQ02880 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
TOP2BQ02880 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC41.77■■■■■ 4.28
TOP2BQ02880 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC41.77■■■■■ 4.28
TOP2BQ02880 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
TOP2BQ02880 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
TOP2BQ02880 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC41.77■■■■■ 4.28
TOP2BQ02880 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
TOP2BQ02880 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
TOP2BQ02880 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
TOP2BQ02880 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC41.76■■■■■ 4.28
TOP2BQ02880 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC41.76■■■■■ 4.28
TOP2BQ02880 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC41.76■■■■■ 4.28
TOP2BQ02880 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
TOP2BQ02880 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC41.74■■■■■ 4.27
TOP2BQ02880 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
TOP2BQ02880 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
TOP2BQ02880 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC41.74■■■■■ 4.27
TOP2BQ02880 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC41.73■■■■■ 4.27
TOP2BQ02880 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
TOP2BQ02880 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
TOP2BQ02880 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
TOP2BQ02880 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.72■■■■■ 4.27
TOP2BQ02880 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
TOP2BQ02880 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.71■■■■■ 4.27
TOP2BQ02880 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
TOP2BQ02880 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
TOP2BQ02880 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
TOP2BQ02880 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.7■■■■■ 4.27
TOP2BQ02880 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
TOP2BQ02880 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC41.69■■■■■ 4.27
TOP2BQ02880 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC41.69■■■■■ 4.27
TOP2BQ02880 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.69■■■■■ 4.26
TOP2BQ02880 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
TOP2BQ02880 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC41.69■■■■■ 4.26
TOP2BQ02880 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC41.69■■■■■ 4.26
TOP2BQ02880 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC41.69■■■■■ 4.26
TOP2BQ02880 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
TOP2BQ02880 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC41.68■■■■■ 4.26
TOP2BQ02880 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
TOP2BQ02880 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
TOP2BQ02880 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.67■■■■■ 4.26
TOP2BQ02880 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC41.66■■■■■ 4.26
TOP2BQ02880 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
TOP2BQ02880 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC41.66■■■■■ 4.26
TOP2BQ02880 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
TOP2BQ02880 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC41.65■■■■■ 4.26
TOP2BQ02880 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
TOP2BQ02880 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC41.64■■■■■ 4.26
TOP2BQ02880 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC41.64■■■■■ 4.26
TOP2BQ02880 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC41.64■■■■■ 4.26
TOP2BQ02880 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC41.63■■■■■ 4.25
TOP2BQ02880 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.62■■■■■ 4.25
TOP2BQ02880 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.62■■■■■ 4.25
TOP2BQ02880 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
TOP2BQ02880 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
TOP2BQ02880 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
TOP2BQ02880 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC41.61■■■■■ 4.25
TOP2BQ02880 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
TOP2BQ02880 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC41.6■■■■■ 4.25
TOP2BQ02880 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC41.6■■■■■ 4.25
TOP2BQ02880 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.6■■■■■ 4.25
TOP2BQ02880 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
TOP2BQ02880 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC41.59■■■■■ 4.25
TOP2BQ02880 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
TOP2BQ02880 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC41.58■■■■■ 4.25
TOP2BQ02880 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
TOP2BQ02880 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC41.58■■■■■ 4.25
TOP2BQ02880 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
TOP2BQ02880 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
TOP2BQ02880 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC41.58■■■■■ 4.25
TOP2BQ02880 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC41.58■■■■■ 4.25
TOP2BQ02880 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC41.57■■■■■ 4.25
TOP2BQ02880 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.25
TOP2BQ02880 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.25
TOP2BQ02880 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.56■■■■■ 4.24
TOP2BQ02880 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.56■■■■■ 4.24
TOP2BQ02880 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC41.56■■■■■ 4.24
TOP2BQ02880 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
TOP2BQ02880 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.56■■■■■ 4.24
TOP2BQ02880 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.56■■■■■ 4.24
TOP2BQ02880 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.55■■■■■ 4.24
TOP2BQ02880 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
TOP2BQ02880 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
TOP2BQ02880 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC41.54■■■■■ 4.24
TOP2BQ02880 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms