Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
XPCQ01831 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
XPCQ01831 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
XPCQ01831 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
XPCQ01831 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
XPCQ01831 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
XPCQ01831 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
XPCQ01831 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
XPCQ01831 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
XPCQ01831 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
XPCQ01831 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
XPCQ01831 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
XPCQ01831 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
XPCQ01831 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
XPCQ01831 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
XPCQ01831 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC34.07■■■■□ 3.04
XPCQ01831 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
XPCQ01831 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
XPCQ01831 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
XPCQ01831 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
XPCQ01831 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
XPCQ01831 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
XPCQ01831 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
XPCQ01831 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
XPCQ01831 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
XPCQ01831 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
XPCQ01831 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
XPCQ01831 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
XPCQ01831 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
XPCQ01831 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
XPCQ01831 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
XPCQ01831 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
XPCQ01831 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
XPCQ01831 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
XPCQ01831 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
XPCQ01831 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
XPCQ01831 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
XPCQ01831 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
XPCQ01831 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
XPCQ01831 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
XPCQ01831 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
XPCQ01831 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
XPCQ01831 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
XPCQ01831 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
XPCQ01831 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
XPCQ01831 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC33.95■■■■□ 3.03
XPCQ01831 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
XPCQ01831 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
XPCQ01831 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
XPCQ01831 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
XPCQ01831 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
XPCQ01831 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
XPCQ01831 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
XPCQ01831 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
XPCQ01831 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
XPCQ01831 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
XPCQ01831 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
XPCQ01831 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
XPCQ01831 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
XPCQ01831 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
XPCQ01831 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
XPCQ01831 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
XPCQ01831 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
XPCQ01831 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
XPCQ01831 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
XPCQ01831 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
XPCQ01831 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
XPCQ01831 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
XPCQ01831 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
XPCQ01831 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
XPCQ01831 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
XPCQ01831 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
XPCQ01831 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
XPCQ01831 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
XPCQ01831 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
XPCQ01831 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
XPCQ01831 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
XPCQ01831 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
XPCQ01831 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC33.87■■■■□ 3.01
XPCQ01831 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC33.87■■■■□ 3.01
XPCQ01831 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC33.86■■■■□ 3.01
XPCQ01831 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
XPCQ01831 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
XPCQ01831 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
XPCQ01831 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
XPCQ01831 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC33.85■■■■□ 3.01
XPCQ01831 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
XPCQ01831 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
XPCQ01831 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
XPCQ01831 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
XPCQ01831 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
XPCQ01831 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC33.83■■■■□ 3.01
XPCQ01831 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
XPCQ01831 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
XPCQ01831 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC33.82■■■■□ 3.01
XPCQ01831 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
XPCQ01831 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC33.82■■■■□ 3
XPCQ01831 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
XPCQ01831 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC33.81■■■■□ 3
XPCQ01831 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms