Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IFITM3Q01628 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
IFITM3Q01628 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IFITM3Q01628 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IFITM3Q01628 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IFITM3Q01628 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IFITM3Q01628 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
IFITM3Q01628 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IFITM3Q01628 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IFITM3Q01628 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IFITM3Q01628 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
IFITM3Q01628 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
IFITM3Q01628 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IFITM3Q01628 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IFITM3Q01628 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IFITM3Q01628 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
IFITM3Q01628 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IFITM3Q01628 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
IFITM3Q01628 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
IFITM3Q01628 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
IFITM3Q01628 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IFITM3Q01628 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IFITM3Q01628 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IFITM3Q01628 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IFITM3Q01628 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IFITM3Q01628 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
IFITM3Q01628 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IFITM3Q01628 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
IFITM3Q01628 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IFITM3Q01628 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
IFITM3Q01628 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFITM3Q01628 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFITM3Q01628 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFITM3Q01628 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFITM3Q01628 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
IFITM3Q01628 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
IFITM3Q01628 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFITM3Q01628 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFITM3Q01628 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFITM3Q01628 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFITM3Q01628 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFITM3Q01628 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFITM3Q01628 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFITM3Q01628 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
IFITM3Q01628 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFITM3Q01628 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFITM3Q01628 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFITM3Q01628 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFITM3Q01628 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFITM3Q01628 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFITM3Q01628 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFITM3Q01628 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFITM3Q01628 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFITM3Q01628 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFITM3Q01628 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFITM3Q01628 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFITM3Q01628 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFITM3Q01628 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFITM3Q01628 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFITM3Q01628 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFITM3Q01628 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFITM3Q01628 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFITM3Q01628 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFITM3Q01628 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFITM3Q01628 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFITM3Q01628 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFITM3Q01628 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFITM3Q01628 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFITM3Q01628 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFITM3Q01628 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFITM3Q01628 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFITM3Q01628 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IFITM3Q01628 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
IFITM3Q01628 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
IFITM3Q01628 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IFITM3Q01628 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IFITM3Q01628 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
IFITM3Q01628 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IFITM3Q01628 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFITM3Q01628 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFITM3Q01628 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFITM3Q01628 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFITM3Q01628 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFITM3Q01628 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFITM3Q01628 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFITM3Q01628 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFITM3Q01628 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFITM3Q01628 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
IFITM3Q01628 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFITM3Q01628 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFITM3Q01628 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFITM3Q01628 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFITM3Q01628 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFITM3Q01628 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFITM3Q01628 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFITM3Q01628 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFITM3Q01628 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFITM3Q01628 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFITM3Q01628 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFITM3Q01628 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.8 ms