Protein–RNA interactions for Protein: Q00005

PPP2R2B, Serine/threonine-protein phosphatase 2A 55 kDa regulatory subunit B beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP2R2BQ00005 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP2R2BQ00005 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP2R2BQ00005 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP2R2BQ00005 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP2R2BQ00005 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP2R2BQ00005 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP2R2BQ00005 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP2R2BQ00005 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP2R2BQ00005 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP2R2BQ00005 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP2R2BQ00005 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP2R2BQ00005 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP2R2BQ00005 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP2R2BQ00005 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP2R2BQ00005 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP2R2BQ00005 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP2R2BQ00005 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP2R2BQ00005 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
PPP2R2BQ00005 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP2R2BQ00005 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP2R2BQ00005 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP2R2BQ00005 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP2R2BQ00005 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP2R2BQ00005 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP2R2BQ00005 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP2R2BQ00005 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP2R2BQ00005 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP2R2BQ00005 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP2R2BQ00005 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP2R2BQ00005 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP2R2BQ00005 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP2R2BQ00005 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP2R2BQ00005 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP2R2BQ00005 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP2R2BQ00005 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP2R2BQ00005 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP2R2BQ00005 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP2R2BQ00005 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP2R2BQ00005 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP2R2BQ00005 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP2R2BQ00005 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP2R2BQ00005 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP2R2BQ00005 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP2R2BQ00005 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP2R2BQ00005 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PPP2R2BQ00005 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP2R2BQ00005 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP2R2BQ00005 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP2R2BQ00005 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP2R2BQ00005 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP2R2BQ00005 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP2R2BQ00005 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPP2R2BQ00005 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP2R2BQ00005 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP2R2BQ00005 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP2R2BQ00005 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP2R2BQ00005 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP2R2BQ00005 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP2R2BQ00005 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP2R2BQ00005 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP2R2BQ00005 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP2R2BQ00005 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP2R2BQ00005 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP2R2BQ00005 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP2R2BQ00005 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP2R2BQ00005 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP2R2BQ00005 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP2R2BQ00005 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP2R2BQ00005 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP2R2BQ00005 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP2R2BQ00005 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP2R2BQ00005 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP2R2BQ00005 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP2R2BQ00005 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP2R2BQ00005 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP2R2BQ00005 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP2R2BQ00005 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP2R2BQ00005 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP2R2BQ00005 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP2R2BQ00005 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP2R2BQ00005 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP2R2BQ00005 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP2R2BQ00005 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP2R2BQ00005 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP2R2BQ00005 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP2R2BQ00005 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP2R2BQ00005 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP2R2BQ00005 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP2R2BQ00005 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP2R2BQ00005 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP2R2BQ00005 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP2R2BQ00005 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP2R2BQ00005 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP2R2BQ00005 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP2R2BQ00005 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP2R2BQ00005 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP2R2BQ00005 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP2R2BQ00005 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP2R2BQ00005 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPP2R2BQ00005 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms