Protein–RNA interactions for Protein: P84074

HPCA, Neuron-specific calcium-binding protein hippocalcin, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAP84074 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HPCAP84074 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HPCAP84074 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HPCAP84074 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HPCAP84074 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HPCAP84074 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HPCAP84074 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HPCAP84074 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HPCAP84074 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HPCAP84074 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HPCAP84074 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HPCAP84074 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HPCAP84074 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HPCAP84074 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HPCAP84074 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HPCAP84074 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HPCAP84074 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HPCAP84074 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HPCAP84074 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HPCAP84074 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HPCAP84074 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HPCAP84074 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HPCAP84074 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HPCAP84074 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HPCAP84074 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HPCAP84074 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HPCAP84074 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HPCAP84074 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HPCAP84074 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HPCAP84074 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HPCAP84074 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HPCAP84074 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HPCAP84074 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HPCAP84074 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HPCAP84074 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HPCAP84074 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HPCAP84074 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HPCAP84074 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HPCAP84074 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HPCAP84074 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HPCAP84074 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HPCAP84074 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HPCAP84074 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HPCAP84074 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HPCAP84074 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HPCAP84074 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HPCAP84074 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HPCAP84074 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HPCAP84074 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HPCAP84074 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HPCAP84074 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HPCAP84074 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HPCAP84074 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HPCAP84074 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HPCAP84074 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HPCAP84074 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HPCAP84074 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HPCAP84074 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HPCAP84074 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HPCAP84074 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HPCAP84074 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HPCAP84074 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HPCAP84074 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HPCAP84074 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HPCAP84074 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HPCAP84074 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HPCAP84074 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HPCAP84074 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HPCAP84074 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HPCAP84074 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HPCAP84074 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HPCAP84074 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HPCAP84074 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HPCAP84074 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HPCAP84074 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HPCAP84074 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HPCAP84074 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HPCAP84074 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HPCAP84074 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HPCAP84074 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HPCAP84074 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HPCAP84074 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HPCAP84074 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HPCAP84074 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HPCAP84074 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HPCAP84074 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HPCAP84074 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HPCAP84074 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HPCAP84074 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HPCAP84074 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HPCAP84074 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HPCAP84074 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HPCAP84074 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HPCAP84074 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HPCAP84074 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HPCAP84074 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HPCAP84074 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HPCAP84074 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HPCAP84074 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HPCAP84074 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms