Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIM1P81133 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIM1P81133 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIM1P81133 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIM1P81133 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIM1P81133 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIM1P81133 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIM1P81133 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIM1P81133 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIM1P81133 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIM1P81133 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIM1P81133 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SIM1P81133 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIM1P81133 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIM1P81133 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIM1P81133 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIM1P81133 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIM1P81133 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIM1P81133 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SIM1P81133 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIM1P81133 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIM1P81133 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SIM1P81133 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIM1P81133 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SIM1P81133 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SIM1P81133 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIM1P81133 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIM1P81133 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIM1P81133 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIM1P81133 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIM1P81133 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIM1P81133 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIM1P81133 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIM1P81133 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIM1P81133 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SIM1P81133 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIM1P81133 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIM1P81133 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SIM1P81133 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIM1P81133 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIM1P81133 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIM1P81133 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIM1P81133 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SIM1P81133 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SIM1P81133 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SIM1P81133 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIM1P81133 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIM1P81133 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIM1P81133 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIM1P81133 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIM1P81133 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIM1P81133 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIM1P81133 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIM1P81133 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIM1P81133 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIM1P81133 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIM1P81133 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIM1P81133 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SIM1P81133 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SIM1P81133 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIM1P81133 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIM1P81133 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIM1P81133 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIM1P81133 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIM1P81133 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIM1P81133 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIM1P81133 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIM1P81133 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIM1P81133 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIM1P81133 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIM1P81133 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIM1P81133 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIM1P81133 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIM1P81133 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIM1P81133 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIM1P81133 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIM1P81133 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIM1P81133 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIM1P81133 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SIM1P81133 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIM1P81133 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIM1P81133 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIM1P81133 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIM1P81133 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SIM1P81133 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SIM1P81133 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SIM1P81133 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SIM1P81133 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SIM1P81133 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SIM1P81133 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SIM1P81133 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SIM1P81133 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SIM1P81133 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIM1P81133 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SIM1P81133 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIM1P81133 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIM1P81133 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SIM1P81133 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIM1P81133 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SIM1P81133 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms