Protein–RNA interactions for Protein: P78312

FAM193A, Protein FAM193A, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM193AP78312 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FAM193AP78312 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FAM193AP78312 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FAM193AP78312 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FAM193AP78312 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FAM193AP78312 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FAM193AP78312 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FAM193AP78312 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FAM193AP78312 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FAM193AP78312 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FAM193AP78312 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FAM193AP78312 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FAM193AP78312 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FAM193AP78312 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FAM193AP78312 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FAM193AP78312 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FAM193AP78312 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FAM193AP78312 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FAM193AP78312 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
FAM193AP78312 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FAM193AP78312 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FAM193AP78312 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FAM193AP78312 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FAM193AP78312 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FAM193AP78312 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
FAM193AP78312 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FAM193AP78312 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FAM193AP78312 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FAM193AP78312 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FAM193AP78312 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FAM193AP78312 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FAM193AP78312 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FAM193AP78312 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FAM193AP78312 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FAM193AP78312 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FAM193AP78312 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FAM193AP78312 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FAM193AP78312 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FAM193AP78312 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FAM193AP78312 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FAM193AP78312 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FAM193AP78312 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FAM193AP78312 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FAM193AP78312 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FAM193AP78312 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FAM193AP78312 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FAM193AP78312 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FAM193AP78312 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FAM193AP78312 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
FAM193AP78312 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FAM193AP78312 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FAM193AP78312 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FAM193AP78312 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FAM193AP78312 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FAM193AP78312 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FAM193AP78312 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FAM193AP78312 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FAM193AP78312 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FAM193AP78312 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FAM193AP78312 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FAM193AP78312 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FAM193AP78312 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
FAM193AP78312 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FAM193AP78312 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FAM193AP78312 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FAM193AP78312 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FAM193AP78312 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FAM193AP78312 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FAM193AP78312 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FAM193AP78312 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FAM193AP78312 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
FAM193AP78312 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FAM193AP78312 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
FAM193AP78312 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FAM193AP78312 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FAM193AP78312 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FAM193AP78312 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FAM193AP78312 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FAM193AP78312 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FAM193AP78312 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FAM193AP78312 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FAM193AP78312 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FAM193AP78312 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FAM193AP78312 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FAM193AP78312 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FAM193AP78312 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FAM193AP78312 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FAM193AP78312 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FAM193AP78312 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FAM193AP78312 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FAM193AP78312 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FAM193AP78312 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FAM193AP78312 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FAM193AP78312 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FAM193AP78312 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FAM193AP78312 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FAM193AP78312 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
FAM193AP78312 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FAM193AP78312 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FAM193AP78312 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms