Protein–RNA interactions for Protein: P63145

ERVK-24, Endogenous retrovirus group K member 24 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-24P63145 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ERVK-24P63145 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ERVK-24P63145 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ERVK-24P63145 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ERVK-24P63145 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
ERVK-24P63145 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
ERVK-24P63145 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ERVK-24P63145 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ERVK-24P63145 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ERVK-24P63145 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ERVK-24P63145 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ERVK-24P63145 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ERVK-24P63145 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ERVK-24P63145 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ERVK-24P63145 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ERVK-24P63145 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ERVK-24P63145 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
ERVK-24P63145 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ERVK-24P63145 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ERVK-24P63145 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ERVK-24P63145 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ERVK-24P63145 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
ERVK-24P63145 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ERVK-24P63145 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ERVK-24P63145 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ERVK-24P63145 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ERVK-24P63145 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
ERVK-24P63145 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ERVK-24P63145 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ERVK-24P63145 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ERVK-24P63145 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ERVK-24P63145 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ERVK-24P63145 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ERVK-24P63145 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ERVK-24P63145 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
ERVK-24P63145 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ERVK-24P63145 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ERVK-24P63145 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ERVK-24P63145 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ERVK-24P63145 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
ERVK-24P63145 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ERVK-24P63145 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ERVK-24P63145 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ERVK-24P63145 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ERVK-24P63145 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ERVK-24P63145 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ERVK-24P63145 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ERVK-24P63145 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ERVK-24P63145 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
ERVK-24P63145 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ERVK-24P63145 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
ERVK-24P63145 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ERVK-24P63145 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ERVK-24P63145 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ERVK-24P63145 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ERVK-24P63145 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ERVK-24P63145 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ERVK-24P63145 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ERVK-24P63145 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ERVK-24P63145 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ERVK-24P63145 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ERVK-24P63145 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ERVK-24P63145 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ERVK-24P63145 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ERVK-24P63145 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ERVK-24P63145 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ERVK-24P63145 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ERVK-24P63145 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ERVK-24P63145 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ERVK-24P63145 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ERVK-24P63145 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ERVK-24P63145 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ERVK-24P63145 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ERVK-24P63145 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ERVK-24P63145 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ERVK-24P63145 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ERVK-24P63145 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
ERVK-24P63145 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ERVK-24P63145 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ERVK-24P63145 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ERVK-24P63145 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ERVK-24P63145 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ERVK-24P63145 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ERVK-24P63145 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ERVK-24P63145 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ERVK-24P63145 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
ERVK-24P63145 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ERVK-24P63145 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
ERVK-24P63145 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ERVK-24P63145 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ERVK-24P63145 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ERVK-24P63145 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ERVK-24P63145 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
ERVK-24P63145 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ERVK-24P63145 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ERVK-24P63145 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ERVK-24P63145 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ERVK-24P63145 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
ERVK-24P63145 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ERVK-24P63145 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms