Protein–RNA interactions for Protein: P62330

ARF6, ADP-ribosylation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF6P62330 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ARF6P62330 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARF6P62330 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARF6P62330 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARF6P62330 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARF6P62330 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARF6P62330 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARF6P62330 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ARF6P62330 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARF6P62330 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARF6P62330 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARF6P62330 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARF6P62330 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARF6P62330 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARF6P62330 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARF6P62330 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ARF6P62330 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
ARF6P62330 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARF6P62330 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARF6P62330 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARF6P62330 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARF6P62330 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARF6P62330 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARF6P62330 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARF6P62330 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ARF6P62330 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARF6P62330 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARF6P62330 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARF6P62330 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARF6P62330 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ARF6P62330 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
ARF6P62330 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARF6P62330 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ARF6P62330 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARF6P62330 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARF6P62330 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARF6P62330 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARF6P62330 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARF6P62330 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARF6P62330 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARF6P62330 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
ARF6P62330 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARF6P62330 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ARF6P62330 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARF6P62330 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARF6P62330 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARF6P62330 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARF6P62330 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARF6P62330 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ARF6P62330 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARF6P62330 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
ARF6P62330 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARF6P62330 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ARF6P62330 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARF6P62330 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ARF6P62330 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARF6P62330 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ARF6P62330 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARF6P62330 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARF6P62330 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARF6P62330 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARF6P62330 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARF6P62330 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARF6P62330 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARF6P62330 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARF6P62330 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARF6P62330 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARF6P62330 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARF6P62330 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARF6P62330 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARF6P62330 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARF6P62330 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARF6P62330 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARF6P62330 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARF6P62330 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARF6P62330 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARF6P62330 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ARF6P62330 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARF6P62330 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ARF6P62330 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARF6P62330 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARF6P62330 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARF6P62330 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARF6P62330 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARF6P62330 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARF6P62330 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARF6P62330 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ARF6P62330 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARF6P62330 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ARF6P62330 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARF6P62330 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARF6P62330 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARF6P62330 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARF6P62330 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARF6P62330 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARF6P62330 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ARF6P62330 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARF6P62330 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ARF6P62330 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ARF6P62330 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms