Protein–RNA interactions for Protein: P62318

SNRPD3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD3P62318 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNRPD3P62318 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNRPD3P62318 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SNRPD3P62318 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SNRPD3P62318 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNRPD3P62318 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNRPD3P62318 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SNRPD3P62318 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNRPD3P62318 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNRPD3P62318 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNRPD3P62318 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SNRPD3P62318 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNRPD3P62318 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNRPD3P62318 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNRPD3P62318 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNRPD3P62318 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SNRPD3P62318 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNRPD3P62318 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNRPD3P62318 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNRPD3P62318 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SNRPD3P62318 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNRPD3P62318 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SNRPD3P62318 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNRPD3P62318 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNRPD3P62318 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNRPD3P62318 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNRPD3P62318 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNRPD3P62318 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SNRPD3P62318 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNRPD3P62318 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNRPD3P62318 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNRPD3P62318 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNRPD3P62318 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SNRPD3P62318 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNRPD3P62318 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNRPD3P62318 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNRPD3P62318 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNRPD3P62318 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNRPD3P62318 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNRPD3P62318 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNRPD3P62318 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNRPD3P62318 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNRPD3P62318 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNRPD3P62318 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNRPD3P62318 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNRPD3P62318 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNRPD3P62318 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNRPD3P62318 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNRPD3P62318 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNRPD3P62318 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNRPD3P62318 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNRPD3P62318 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNRPD3P62318 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNRPD3P62318 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNRPD3P62318 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNRPD3P62318 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNRPD3P62318 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNRPD3P62318 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNRPD3P62318 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNRPD3P62318 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNRPD3P62318 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNRPD3P62318 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNRPD3P62318 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNRPD3P62318 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SNRPD3P62318 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNRPD3P62318 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNRPD3P62318 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNRPD3P62318 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNRPD3P62318 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNRPD3P62318 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNRPD3P62318 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNRPD3P62318 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNRPD3P62318 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNRPD3P62318 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNRPD3P62318 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNRPD3P62318 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNRPD3P62318 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNRPD3P62318 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNRPD3P62318 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNRPD3P62318 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNRPD3P62318 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNRPD3P62318 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNRPD3P62318 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNRPD3P62318 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNRPD3P62318 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNRPD3P62318 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNRPD3P62318 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNRPD3P62318 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNRPD3P62318 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNRPD3P62318 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNRPD3P62318 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNRPD3P62318 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNRPD3P62318 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNRPD3P62318 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNRPD3P62318 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNRPD3P62318 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNRPD3P62318 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SNRPD3P62318 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNRPD3P62318 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNRPD3P62318 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms