Protein–RNA interactions for Protein: P62314

SNRPD1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD1P62314 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNRPD1P62314 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNRPD1P62314 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNRPD1P62314 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNRPD1P62314 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNRPD1P62314 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNRPD1P62314 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNRPD1P62314 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNRPD1P62314 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNRPD1P62314 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNRPD1P62314 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNRPD1P62314 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNRPD1P62314 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNRPD1P62314 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNRPD1P62314 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNRPD1P62314 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNRPD1P62314 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNRPD1P62314 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SNRPD1P62314 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNRPD1P62314 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNRPD1P62314 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNRPD1P62314 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNRPD1P62314 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNRPD1P62314 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNRPD1P62314 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNRPD1P62314 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SNRPD1P62314 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNRPD1P62314 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNRPD1P62314 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNRPD1P62314 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNRPD1P62314 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SNRPD1P62314 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SNRPD1P62314 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNRPD1P62314 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SNRPD1P62314 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNRPD1P62314 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNRPD1P62314 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNRPD1P62314 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNRPD1P62314 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SNRPD1P62314 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNRPD1P62314 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SNRPD1P62314 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNRPD1P62314 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNRPD1P62314 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SNRPD1P62314 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNRPD1P62314 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNRPD1P62314 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNRPD1P62314 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SNRPD1P62314 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNRPD1P62314 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNRPD1P62314 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNRPD1P62314 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNRPD1P62314 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNRPD1P62314 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNRPD1P62314 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNRPD1P62314 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNRPD1P62314 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNRPD1P62314 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNRPD1P62314 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNRPD1P62314 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SNRPD1P62314 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNRPD1P62314 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNRPD1P62314 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNRPD1P62314 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SNRPD1P62314 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNRPD1P62314 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SNRPD1P62314 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNRPD1P62314 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNRPD1P62314 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNRPD1P62314 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SNRPD1P62314 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNRPD1P62314 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNRPD1P62314 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNRPD1P62314 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNRPD1P62314 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SNRPD1P62314 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SNRPD1P62314 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNRPD1P62314 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNRPD1P62314 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNRPD1P62314 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SNRPD1P62314 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNRPD1P62314 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNRPD1P62314 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNRPD1P62314 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNRPD1P62314 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNRPD1P62314 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNRPD1P62314 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNRPD1P62314 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNRPD1P62314 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNRPD1P62314 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNRPD1P62314 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SNRPD1P62314 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNRPD1P62314 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNRPD1P62314 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNRPD1P62314 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNRPD1P62314 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNRPD1P62314 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SNRPD1P62314 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNRPD1P62314 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SNRPD1P62314 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.8 ms