Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERVK_113P61574 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERVK_113P61574 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERVK_113P61574 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
HERVK_113P61574 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERVK_113P61574 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERVK_113P61574 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERVK_113P61574 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERVK_113P61574 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERVK_113P61574 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERVK_113P61574 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
HERVK_113P61574 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERVK_113P61574 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERVK_113P61574 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERVK_113P61574 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERVK_113P61574 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERVK_113P61574 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERVK_113P61574 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HERVK_113P61574 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERVK_113P61574 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERVK_113P61574 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
HERVK_113P61574 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
HERVK_113P61574 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
HERVK_113P61574 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERVK_113P61574 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERVK_113P61574 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERVK_113P61574 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERVK_113P61574 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERVK_113P61574 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERVK_113P61574 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERVK_113P61574 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERVK_113P61574 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERVK_113P61574 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERVK_113P61574 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERVK_113P61574 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113P61574 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113P61574 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113P61574 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113P61574 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113P61574 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113P61574 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERVK_113P61574 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113P61574 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113P61574 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113P61574 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113P61574 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113P61574 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113P61574 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113P61574 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERVK_113P61574 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113P61574 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113P61574 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113P61574 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113P61574 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113P61574 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113P61574 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113P61574 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113P61574 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERVK_113P61574 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113P61574 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113P61574 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113P61574 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113P61574 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113P61574 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113P61574 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113P61574 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113P61574 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113P61574 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113P61574 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERVK_113P61574 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113P61574 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113P61574 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113P61574 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113P61574 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERVK_113P61574 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113P61574 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113P61574 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113P61574 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113P61574 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113P61574 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113P61574 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113P61574 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113P61574 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HERVK_113P61574 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113P61574 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113P61574 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113P61574 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113P61574 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HERVK_113P61574 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113P61574 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113P61574 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HERVK_113P61574 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERVK_113P61574 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERVK_113P61574 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
HERVK_113P61574 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERVK_113P61574 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERVK_113P61574 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERVK_113P61574 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERVK_113P61574 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HERVK_113P61574 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms