Protein–RNA interactions for Protein: P60606

CTXN1, Cortexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN1P60606 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTXN1P60606 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTXN1P60606 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTXN1P60606 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTXN1P60606 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTXN1P60606 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTXN1P60606 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTXN1P60606 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTXN1P60606 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CTXN1P60606 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTXN1P60606 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTXN1P60606 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTXN1P60606 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CTXN1P60606 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTXN1P60606 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTXN1P60606 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTXN1P60606 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTXN1P60606 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTXN1P60606 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTXN1P60606 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTXN1P60606 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CTXN1P60606 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
CTXN1P60606 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTXN1P60606 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTXN1P60606 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTXN1P60606 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CTXN1P60606 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTXN1P60606 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTXN1P60606 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTXN1P60606 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CTXN1P60606 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CTXN1P60606 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTXN1P60606 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CTXN1P60606 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTXN1P60606 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTXN1P60606 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTXN1P60606 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CTXN1P60606 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTXN1P60606 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTXN1P60606 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTXN1P60606 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CTXN1P60606 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTXN1P60606 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTXN1P60606 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTXN1P60606 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTXN1P60606 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTXN1P60606 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTXN1P60606 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTXN1P60606 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTXN1P60606 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTXN1P60606 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTXN1P60606 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CTXN1P60606 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTXN1P60606 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CTXN1P60606 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTXN1P60606 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CTXN1P60606 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CTXN1P60606 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTXN1P60606 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CTXN1P60606 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTXN1P60606 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTXN1P60606 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTXN1P60606 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTXN1P60606 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTXN1P60606 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CTXN1P60606 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTXN1P60606 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTXN1P60606 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTXN1P60606 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CTXN1P60606 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTXN1P60606 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTXN1P60606 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTXN1P60606 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTXN1P60606 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTXN1P60606 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CTXN1P60606 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTXN1P60606 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTXN1P60606 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTXN1P60606 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTXN1P60606 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTXN1P60606 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTXN1P60606 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTXN1P60606 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTXN1P60606 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTXN1P60606 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTXN1P60606 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CTXN1P60606 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTXN1P60606 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTXN1P60606 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTXN1P60606 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTXN1P60606 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTXN1P60606 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTXN1P60606 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTXN1P60606 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTXN1P60606 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTXN1P60606 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTXN1P60606 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTXN1P60606 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTXN1P60606 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTXN1P60606 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms