Protein–RNA interactions for Protein: P56748

CLDN8, Claudin-8, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN8P56748 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLDN8P56748 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLDN8P56748 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLDN8P56748 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLDN8P56748 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLDN8P56748 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLDN8P56748 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLDN8P56748 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLDN8P56748 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLDN8P56748 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLDN8P56748 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLDN8P56748 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLDN8P56748 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLDN8P56748 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLDN8P56748 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLDN8P56748 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLDN8P56748 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLDN8P56748 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLDN8P56748 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CLDN8P56748 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CLDN8P56748 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CLDN8P56748 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLDN8P56748 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLDN8P56748 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLDN8P56748 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLDN8P56748 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CLDN8P56748 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CLDN8P56748 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CLDN8P56748 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CLDN8P56748 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLDN8P56748 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLDN8P56748 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLDN8P56748 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLDN8P56748 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CLDN8P56748 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLDN8P56748 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLDN8P56748 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLDN8P56748 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLDN8P56748 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLDN8P56748 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLDN8P56748 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLDN8P56748 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLDN8P56748 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLDN8P56748 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLDN8P56748 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLDN8P56748 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLDN8P56748 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLDN8P56748 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLDN8P56748 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLDN8P56748 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLDN8P56748 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLDN8P56748 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CLDN8P56748 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLDN8P56748 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLDN8P56748 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLDN8P56748 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLDN8P56748 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLDN8P56748 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLDN8P56748 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLDN8P56748 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLDN8P56748 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLDN8P56748 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLDN8P56748 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLDN8P56748 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLDN8P56748 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CLDN8P56748 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLDN8P56748 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLDN8P56748 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLDN8P56748 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLDN8P56748 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLDN8P56748 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLDN8P56748 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CLDN8P56748 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLDN8P56748 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLDN8P56748 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLDN8P56748 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLDN8P56748 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLDN8P56748 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLDN8P56748 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CLDN8P56748 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLDN8P56748 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLDN8P56748 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CLDN8P56748 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLDN8P56748 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLDN8P56748 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLDN8P56748 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLDN8P56748 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLDN8P56748 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CLDN8P56748 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLDN8P56748 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLDN8P56748 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLDN8P56748 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLDN8P56748 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLDN8P56748 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLDN8P56748 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLDN8P56748 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLDN8P56748 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLDN8P56748 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLDN8P56748 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLDN8P56748 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms