Protein–RNA interactions for Protein: P56645

PER3, Period circadian protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PER3P56645 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PER3P56645 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PER3P56645 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PER3P56645 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PER3P56645 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PER3P56645 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PER3P56645 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PER3P56645 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PER3P56645 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PER3P56645 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PER3P56645 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PER3P56645 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PER3P56645 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PER3P56645 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PER3P56645 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PER3P56645 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PER3P56645 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PER3P56645 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PER3P56645 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PER3P56645 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PER3P56645 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PER3P56645 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PER3P56645 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PER3P56645 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PER3P56645 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PER3P56645 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PER3P56645 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PER3P56645 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PER3P56645 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PER3P56645 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PER3P56645 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PER3P56645 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PER3P56645 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PER3P56645 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PER3P56645 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PER3P56645 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PER3P56645 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PER3P56645 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PER3P56645 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PER3P56645 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PER3P56645 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PER3P56645 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PER3P56645 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PER3P56645 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PER3P56645 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PER3P56645 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PER3P56645 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PER3P56645 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PER3P56645 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PER3P56645 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PER3P56645 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PER3P56645 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PER3P56645 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PER3P56645 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PER3P56645 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PER3P56645 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PER3P56645 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PER3P56645 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PER3P56645 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PER3P56645 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PER3P56645 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PER3P56645 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PER3P56645 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PER3P56645 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PER3P56645 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PER3P56645 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PER3P56645 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PER3P56645 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PER3P56645 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PER3P56645 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PER3P56645 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PER3P56645 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PER3P56645 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PER3P56645 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PER3P56645 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PER3P56645 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PER3P56645 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PER3P56645 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PER3P56645 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PER3P56645 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PER3P56645 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PER3P56645 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PER3P56645 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PER3P56645 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PER3P56645 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PER3P56645 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PER3P56645 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PER3P56645 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PER3P56645 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PER3P56645 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PER3P56645 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PER3P56645 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PER3P56645 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PER3P56645 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PER3P56645 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PER3P56645 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PER3P56645 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PER3P56645 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PER3P56645 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PER3P56645 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms