Protein–RNA interactions for Protein: P55899

FCGRT, IgG receptor FcRn large subunit p51, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCGRTP55899 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FCGRTP55899 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FCGRTP55899 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FCGRTP55899 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
FCGRTP55899 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FCGRTP55899 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FCGRTP55899 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FCGRTP55899 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
FCGRTP55899 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FCGRTP55899 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FCGRTP55899 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FCGRTP55899 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
FCGRTP55899 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FCGRTP55899 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FCGRTP55899 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FCGRTP55899 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FCGRTP55899 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FCGRTP55899 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FCGRTP55899 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FCGRTP55899 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FCGRTP55899 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FCGRTP55899 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
FCGRTP55899 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FCGRTP55899 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FCGRTP55899 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FCGRTP55899 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FCGRTP55899 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FCGRTP55899 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FCGRTP55899 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FCGRTP55899 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FCGRTP55899 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FCGRTP55899 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FCGRTP55899 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FCGRTP55899 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
FCGRTP55899 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FCGRTP55899 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
FCGRTP55899 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FCGRTP55899 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FCGRTP55899 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
FCGRTP55899 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FCGRTP55899 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FCGRTP55899 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FCGRTP55899 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FCGRTP55899 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FCGRTP55899 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FCGRTP55899 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FCGRTP55899 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FCGRTP55899 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FCGRTP55899 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FCGRTP55899 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FCGRTP55899 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FCGRTP55899 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FCGRTP55899 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
FCGRTP55899 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FCGRTP55899 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FCGRTP55899 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FCGRTP55899 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FCGRTP55899 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
FCGRTP55899 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FCGRTP55899 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
FCGRTP55899 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FCGRTP55899 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FCGRTP55899 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FCGRTP55899 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
FCGRTP55899 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
FCGRTP55899 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FCGRTP55899 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FCGRTP55899 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FCGRTP55899 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FCGRTP55899 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FCGRTP55899 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FCGRTP55899 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FCGRTP55899 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FCGRTP55899 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FCGRTP55899 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FCGRTP55899 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FCGRTP55899 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FCGRTP55899 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FCGRTP55899 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FCGRTP55899 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FCGRTP55899 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FCGRTP55899 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
FCGRTP55899 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FCGRTP55899 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FCGRTP55899 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FCGRTP55899 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
FCGRTP55899 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FCGRTP55899 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
FCGRTP55899 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FCGRTP55899 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
FCGRTP55899 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FCGRTP55899 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FCGRTP55899 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FCGRTP55899 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FCGRTP55899 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
FCGRTP55899 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FCGRTP55899 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FCGRTP55899 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FCGRTP55899 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FCGRTP55899 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms