Protein–RNA interactions for Protein: P55290

CDH13, Cadherin-13, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH13P55290 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDH13P55290 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDH13P55290 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CDH13P55290 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH13P55290 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH13P55290 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH13P55290 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH13P55290 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH13P55290 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH13P55290 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH13P55290 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CDH13P55290 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH13P55290 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH13P55290 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CDH13P55290 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH13P55290 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH13P55290 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH13P55290 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH13P55290 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH13P55290 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CDH13P55290 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH13P55290 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH13P55290 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH13P55290 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH13P55290 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH13P55290 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH13P55290 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH13P55290 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH13P55290 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH13P55290 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH13P55290 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH13P55290 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CDH13P55290 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH13P55290 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH13P55290 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH13P55290 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH13P55290 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH13P55290 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CDH13P55290 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDH13P55290 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CDH13P55290 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CDH13P55290 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDH13P55290 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CDH13P55290 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CDH13P55290 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDH13P55290 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CDH13P55290 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDH13P55290 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDH13P55290 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CDH13P55290 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDH13P55290 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDH13P55290 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CDH13P55290 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDH13P55290 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDH13P55290 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDH13P55290 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CDH13P55290 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDH13P55290 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDH13P55290 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CDH13P55290 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDH13P55290 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDH13P55290 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDH13P55290 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CDH13P55290 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDH13P55290 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDH13P55290 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDH13P55290 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDH13P55290 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDH13P55290 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CDH13P55290 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CDH13P55290 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDH13P55290 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDH13P55290 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDH13P55290 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CDH13P55290 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
CDH13P55290 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CDH13P55290 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CDH13P55290 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CDH13P55290 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDH13P55290 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDH13P55290 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDH13P55290 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDH13P55290 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CDH13P55290 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDH13P55290 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDH13P55290 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDH13P55290 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDH13P55290 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDH13P55290 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDH13P55290 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDH13P55290 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CDH13P55290 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDH13P55290 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDH13P55290 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CDH13P55290 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDH13P55290 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDH13P55290 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDH13P55290 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDH13P55290 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDH13P55290 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.3 ms