Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP12AP54707 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP12AP54707 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP12AP54707 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP12AP54707 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP12AP54707 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP12AP54707 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP12AP54707 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP12AP54707 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP12AP54707 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP12AP54707 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP12AP54707 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP12AP54707 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP12AP54707 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP12AP54707 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP12AP54707 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP12AP54707 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP12AP54707 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP12AP54707 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP12AP54707 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP12AP54707 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP12AP54707 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP12AP54707 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP12AP54707 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP12AP54707 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP12AP54707 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP12AP54707 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP12AP54707 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP12AP54707 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP12AP54707 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP12AP54707 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP12AP54707 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP12AP54707 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ATP12AP54707 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ATP12AP54707 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP12AP54707 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP12AP54707 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP12AP54707 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP12AP54707 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP12AP54707 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP12AP54707 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP12AP54707 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP12AP54707 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP12AP54707 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP12AP54707 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP12AP54707 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP12AP54707 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP12AP54707 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP12AP54707 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP12AP54707 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP12AP54707 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP12AP54707 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP12AP54707 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP12AP54707 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP12AP54707 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP12AP54707 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP12AP54707 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP12AP54707 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP12AP54707 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP12AP54707 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP12AP54707 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP12AP54707 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP12AP54707 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP12AP54707 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP12AP54707 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP12AP54707 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP12AP54707 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP12AP54707 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP12AP54707 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP12AP54707 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP12AP54707 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP12AP54707 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP12AP54707 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP12AP54707 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP12AP54707 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP12AP54707 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP12AP54707 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP12AP54707 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP12AP54707 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP12AP54707 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP12AP54707 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP12AP54707 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP12AP54707 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP12AP54707 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP12AP54707 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP12AP54707 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP12AP54707 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP12AP54707 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP12AP54707 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP12AP54707 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP12AP54707 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP12AP54707 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP12AP54707 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP12AP54707 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP12AP54707 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP12AP54707 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP12AP54707 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP12AP54707 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP12AP54707 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP12AP54707 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.1 ms