Protein–RNA interactions for Protein: P54108

CRISP3, Cysteine-rich secretory protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP3P54108 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRISP3P54108 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CRISP3P54108 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRISP3P54108 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRISP3P54108 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRISP3P54108 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRISP3P54108 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CRISP3P54108 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRISP3P54108 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRISP3P54108 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRISP3P54108 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CRISP3P54108 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRISP3P54108 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CRISP3P54108 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRISP3P54108 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRISP3P54108 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRISP3P54108 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CRISP3P54108 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CRISP3P54108 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRISP3P54108 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRISP3P54108 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRISP3P54108 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRISP3P54108 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRISP3P54108 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRISP3P54108 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRISP3P54108 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRISP3P54108 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRISP3P54108 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRISP3P54108 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRISP3P54108 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRISP3P54108 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CRISP3P54108 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CRISP3P54108 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CRISP3P54108 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CRISP3P54108 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRISP3P54108 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRISP3P54108 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRISP3P54108 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRISP3P54108 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRISP3P54108 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRISP3P54108 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRISP3P54108 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRISP3P54108 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRISP3P54108 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRISP3P54108 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRISP3P54108 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRISP3P54108 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRISP3P54108 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRISP3P54108 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRISP3P54108 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRISP3P54108 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRISP3P54108 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRISP3P54108 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRISP3P54108 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRISP3P54108 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRISP3P54108 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRISP3P54108 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRISP3P54108 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRISP3P54108 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRISP3P54108 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRISP3P54108 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRISP3P54108 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRISP3P54108 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRISP3P54108 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRISP3P54108 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRISP3P54108 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRISP3P54108 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRISP3P54108 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRISP3P54108 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRISP3P54108 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRISP3P54108 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRISP3P54108 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRISP3P54108 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRISP3P54108 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRISP3P54108 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRISP3P54108 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRISP3P54108 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CRISP3P54108 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRISP3P54108 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRISP3P54108 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRISP3P54108 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRISP3P54108 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRISP3P54108 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CRISP3P54108 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRISP3P54108 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRISP3P54108 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRISP3P54108 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRISP3P54108 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CRISP3P54108 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRISP3P54108 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRISP3P54108 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRISP3P54108 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRISP3P54108 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CRISP3P54108 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRISP3P54108 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRISP3P54108 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CRISP3P54108 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRISP3P54108 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRISP3P54108 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CRISP3P54108 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms