Protein–RNA interactions for Protein: P53803

POLR2K, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2KP53803 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2KP53803 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
POLR2KP53803 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2KP53803 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2KP53803 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2KP53803 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
POLR2KP53803 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR2KP53803 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR2KP53803 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR2KP53803 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR2KP53803 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR2KP53803 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR2KP53803 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
POLR2KP53803 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
POLR2KP53803 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
POLR2KP53803 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
POLR2KP53803 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
POLR2KP53803 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
POLR2KP53803 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLR2KP53803 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLR2KP53803 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLR2KP53803 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLR2KP53803 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLR2KP53803 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLR2KP53803 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
POLR2KP53803 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR2KP53803 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR2KP53803 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR2KP53803 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR2KP53803 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
POLR2KP53803 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2KP53803 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2KP53803 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2KP53803 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2KP53803 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2KP53803 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2KP53803 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2KP53803 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
POLR2KP53803 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2KP53803 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2KP53803 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2KP53803 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2KP53803 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2KP53803 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2KP53803 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2KP53803 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
POLR2KP53803 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2KP53803 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2KP53803 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2KP53803 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2KP53803 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2KP53803 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2KP53803 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2KP53803 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2KP53803 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2KP53803 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2KP53803 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLR2KP53803 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2KP53803 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2KP53803 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2KP53803 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2KP53803 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2KP53803 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2KP53803 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2KP53803 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLR2KP53803 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLR2KP53803 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLR2KP53803 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLR2KP53803 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
POLR2KP53803 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLR2KP53803 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
POLR2KP53803 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
POLR2KP53803 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2KP53803 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2KP53803 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2KP53803 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2KP53803 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2KP53803 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2KP53803 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2KP53803 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2KP53803 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLR2KP53803 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR2KP53803 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR2KP53803 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
POLR2KP53803 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2KP53803 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2KP53803 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2KP53803 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2KP53803 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2KP53803 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2KP53803 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
POLR2KP53803 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR2KP53803 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR2KP53803 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR2KP53803 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR2KP53803 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR2KP53803 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR2KP53803 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR2KP53803 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR2KP53803 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 526.2 ms