Protein–RNA interactions for Protein: P53365

ARFIP2, Arfaptin-2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP2P53365 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARFIP2P53365 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARFIP2P53365 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARFIP2P53365 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARFIP2P53365 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARFIP2P53365 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARFIP2P53365 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARFIP2P53365 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ARFIP2P53365 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARFIP2P53365 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARFIP2P53365 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARFIP2P53365 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARFIP2P53365 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARFIP2P53365 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARFIP2P53365 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARFIP2P53365 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARFIP2P53365 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARFIP2P53365 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARFIP2P53365 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARFIP2P53365 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARFIP2P53365 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARFIP2P53365 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARFIP2P53365 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARFIP2P53365 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARFIP2P53365 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARFIP2P53365 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARFIP2P53365 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARFIP2P53365 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARFIP2P53365 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARFIP2P53365 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARFIP2P53365 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARFIP2P53365 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARFIP2P53365 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ARFIP2P53365 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARFIP2P53365 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARFIP2P53365 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARFIP2P53365 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARFIP2P53365 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARFIP2P53365 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARFIP2P53365 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARFIP2P53365 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARFIP2P53365 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARFIP2P53365 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ARFIP2P53365 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARFIP2P53365 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARFIP2P53365 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARFIP2P53365 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARFIP2P53365 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARFIP2P53365 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARFIP2P53365 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARFIP2P53365 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARFIP2P53365 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ARFIP2P53365 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARFIP2P53365 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ARFIP2P53365 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ARFIP2P53365 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARFIP2P53365 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ARFIP2P53365 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARFIP2P53365 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARFIP2P53365 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARFIP2P53365 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARFIP2P53365 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARFIP2P53365 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARFIP2P53365 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARFIP2P53365 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARFIP2P53365 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARFIP2P53365 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARFIP2P53365 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARFIP2P53365 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARFIP2P53365 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARFIP2P53365 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARFIP2P53365 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARFIP2P53365 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARFIP2P53365 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARFIP2P53365 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARFIP2P53365 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ARFIP2P53365 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARFIP2P53365 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARFIP2P53365 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARFIP2P53365 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARFIP2P53365 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARFIP2P53365 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ARFIP2P53365 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARFIP2P53365 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARFIP2P53365 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARFIP2P53365 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ARFIP2P53365 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARFIP2P53365 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARFIP2P53365 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARFIP2P53365 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ARFIP2P53365 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ARFIP2P53365 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARFIP2P53365 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARFIP2P53365 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARFIP2P53365 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARFIP2P53365 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARFIP2P53365 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARFIP2P53365 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARFIP2P53365 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARFIP2P53365 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.5 ms