Protein–RNA interactions for Protein: P52790

HK3, Hexokinase-3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HK3P52790 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HK3P52790 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HK3P52790 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HK3P52790 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HK3P52790 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HK3P52790 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HK3P52790 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HK3P52790 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
HK3P52790 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HK3P52790 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HK3P52790 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HK3P52790 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HK3P52790 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HK3P52790 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HK3P52790 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HK3P52790 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HK3P52790 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HK3P52790 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HK3P52790 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HK3P52790 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HK3P52790 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HK3P52790 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HK3P52790 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HK3P52790 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HK3P52790 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HK3P52790 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HK3P52790 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HK3P52790 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HK3P52790 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HK3P52790 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HK3P52790 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HK3P52790 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HK3P52790 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HK3P52790 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HK3P52790 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HK3P52790 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
HK3P52790 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HK3P52790 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HK3P52790 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HK3P52790 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HK3P52790 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HK3P52790 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HK3P52790 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HK3P52790 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HK3P52790 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HK3P52790 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HK3P52790 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HK3P52790 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HK3P52790 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HK3P52790 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HK3P52790 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HK3P52790 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HK3P52790 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HK3P52790 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HK3P52790 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HK3P52790 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HK3P52790 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
HK3P52790 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HK3P52790 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HK3P52790 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HK3P52790 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HK3P52790 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
HK3P52790 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HK3P52790 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
HK3P52790 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HK3P52790 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HK3P52790 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HK3P52790 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HK3P52790 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HK3P52790 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HK3P52790 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HK3P52790 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HK3P52790 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HK3P52790 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HK3P52790 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HK3P52790 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HK3P52790 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
HK3P52790 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HK3P52790 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HK3P52790 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HK3P52790 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HK3P52790 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HK3P52790 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HK3P52790 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HK3P52790 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HK3P52790 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HK3P52790 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HK3P52790 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HK3P52790 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HK3P52790 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HK3P52790 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HK3P52790 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HK3P52790 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HK3P52790 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HK3P52790 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HK3P52790 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HK3P52790 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HK3P52790 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HK3P52790 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HK3P52790 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms