Protein–RNA interactions for Protein: P52788

SMS, Spermine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMSP52788 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMSP52788 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMSP52788 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMSP52788 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMSP52788 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SMSP52788 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SMSP52788 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMSP52788 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SMSP52788 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMSP52788 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMSP52788 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMSP52788 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SMSP52788 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMSP52788 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMSP52788 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SMSP52788 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMSP52788 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMSP52788 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMSP52788 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMSP52788 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMSP52788 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMSP52788 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMSP52788 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMSP52788 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMSP52788 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMSP52788 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMSP52788 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMSP52788 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMSP52788 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMSP52788 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMSP52788 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SMSP52788 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMSP52788 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMSP52788 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMSP52788 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMSP52788 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMSP52788 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMSP52788 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMSP52788 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SMSP52788 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMSP52788 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMSP52788 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMSP52788 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMSP52788 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SMSP52788 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SMSP52788 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMSP52788 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SMSP52788 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SMSP52788 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMSP52788 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMSP52788 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SMSP52788 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMSP52788 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMSP52788 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMSP52788 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SMSP52788 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMSP52788 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMSP52788 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SMSP52788 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SMSP52788 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SMSP52788 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMSP52788 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SMSP52788 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMSP52788 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SMSP52788 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SMSP52788 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
SMSP52788 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMSP52788 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMSP52788 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SMSP52788 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMSP52788 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMSP52788 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMSP52788 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMSP52788 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SMSP52788 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMSP52788 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMSP52788 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SMSP52788 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMSP52788 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMSP52788 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMSP52788 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMSP52788 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SMSP52788 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMSP52788 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SMSP52788 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SMSP52788 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMSP52788 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMSP52788 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMSP52788 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMSP52788 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMSP52788 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMSP52788 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMSP52788 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMSP52788 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMSP52788 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMSP52788 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMSP52788 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMSP52788 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMSP52788 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMSP52788 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms