Protein–RNA interactions for Protein: P52434

POLR2H, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2HP52434 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR2HP52434 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
POLR2HP52434 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR2HP52434 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR2HP52434 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR2HP52434 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR2HP52434 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR2HP52434 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR2HP52434 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
POLR2HP52434 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR2HP52434 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR2HP52434 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR2HP52434 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR2HP52434 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR2HP52434 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR2HP52434 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR2HP52434 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR2HP52434 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR2HP52434 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR2HP52434 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR2HP52434 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR2HP52434 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR2HP52434 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR2HP52434 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR2HP52434 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR2HP52434 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR2HP52434 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR2HP52434 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR2HP52434 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR2HP52434 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR2HP52434 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR2HP52434 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLR2HP52434 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR2HP52434 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR2HP52434 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR2HP52434 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR2HP52434 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR2HP52434 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR2HP52434 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR2HP52434 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR2HP52434 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR2HP52434 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLR2HP52434 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR2HP52434 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR2HP52434 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR2HP52434 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR2HP52434 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR2HP52434 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR2HP52434 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR2HP52434 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR2HP52434 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR2HP52434 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR2HP52434 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLR2HP52434 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR2HP52434 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR2HP52434 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR2HP52434 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR2HP52434 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR2HP52434 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR2HP52434 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR2HP52434 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR2HP52434 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR2HP52434 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR2HP52434 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR2HP52434 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR2HP52434 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR2HP52434 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR2HP52434 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR2HP52434 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR2HP52434 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR2HP52434 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR2HP52434 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR2HP52434 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR2HP52434 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR2HP52434 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR2HP52434 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR2HP52434 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR2HP52434 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR2HP52434 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR2HP52434 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR2HP52434 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR2HP52434 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR2HP52434 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR2HP52434 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR2HP52434 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR2HP52434 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR2HP52434 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR2HP52434 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR2HP52434 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR2HP52434 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR2HP52434 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR2HP52434 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR2HP52434 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR2HP52434 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR2HP52434 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR2HP52434 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR2HP52434 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR2HP52434 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR2HP52434 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
POLR2HP52434 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms