Protein–RNA interactions for Protein: P52294

KPNA1, Importin subunit alpha-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA1P52294 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KPNA1P52294 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KPNA1P52294 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KPNA1P52294 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KPNA1P52294 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KPNA1P52294 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KPNA1P52294 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KPNA1P52294 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KPNA1P52294 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KPNA1P52294 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KPNA1P52294 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KPNA1P52294 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KPNA1P52294 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KPNA1P52294 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KPNA1P52294 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KPNA1P52294 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KPNA1P52294 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KPNA1P52294 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KPNA1P52294 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KPNA1P52294 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KPNA1P52294 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KPNA1P52294 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KPNA1P52294 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KPNA1P52294 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KPNA1P52294 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KPNA1P52294 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KPNA1P52294 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KPNA1P52294 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KPNA1P52294 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KPNA1P52294 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KPNA1P52294 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KPNA1P52294 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KPNA1P52294 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KPNA1P52294 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KPNA1P52294 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KPNA1P52294 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KPNA1P52294 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
KPNA1P52294 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KPNA1P52294 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KPNA1P52294 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KPNA1P52294 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KPNA1P52294 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KPNA1P52294 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KPNA1P52294 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KPNA1P52294 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KPNA1P52294 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KPNA1P52294 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KPNA1P52294 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KPNA1P52294 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KPNA1P52294 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KPNA1P52294 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KPNA1P52294 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KPNA1P52294 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KPNA1P52294 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KPNA1P52294 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KPNA1P52294 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KPNA1P52294 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KPNA1P52294 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KPNA1P52294 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KPNA1P52294 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KPNA1P52294 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
KPNA1P52294 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KPNA1P52294 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KPNA1P52294 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KPNA1P52294 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
KPNA1P52294 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KPNA1P52294 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
KPNA1P52294 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
KPNA1P52294 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KPNA1P52294 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KPNA1P52294 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KPNA1P52294 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KPNA1P52294 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
KPNA1P52294 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
KPNA1P52294 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
KPNA1P52294 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KPNA1P52294 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KPNA1P52294 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KPNA1P52294 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KPNA1P52294 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
KPNA1P52294 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
KPNA1P52294 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KPNA1P52294 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
KPNA1P52294 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KPNA1P52294 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KPNA1P52294 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KPNA1P52294 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KPNA1P52294 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KPNA1P52294 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KPNA1P52294 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KPNA1P52294 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KPNA1P52294 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KPNA1P52294 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KPNA1P52294 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KPNA1P52294 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KPNA1P52294 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KPNA1P52294 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KPNA1P52294 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KPNA1P52294 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KPNA1P52294 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms