Protein–RNA interactions for Protein: P51955

NEK2, Serine/threonine-protein kinase Nek2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK2P51955 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEK2P51955 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEK2P51955 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEK2P51955 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEK2P51955 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NEK2P51955 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NEK2P51955 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEK2P51955 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEK2P51955 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NEK2P51955 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEK2P51955 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEK2P51955 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEK2P51955 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEK2P51955 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NEK2P51955 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NEK2P51955 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEK2P51955 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NEK2P51955 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEK2P51955 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NEK2P51955 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NEK2P51955 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NEK2P51955 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NEK2P51955 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEK2P51955 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEK2P51955 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEK2P51955 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEK2P51955 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NEK2P51955 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEK2P51955 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEK2P51955 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEK2P51955 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NEK2P51955 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEK2P51955 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEK2P51955 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEK2P51955 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEK2P51955 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NEK2P51955 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEK2P51955 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEK2P51955 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEK2P51955 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEK2P51955 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEK2P51955 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEK2P51955 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEK2P51955 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEK2P51955 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NEK2P51955 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEK2P51955 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEK2P51955 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEK2P51955 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEK2P51955 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NEK2P51955 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEK2P51955 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEK2P51955 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEK2P51955 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEK2P51955 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NEK2P51955 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEK2P51955 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEK2P51955 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEK2P51955 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NEK2P51955 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NEK2P51955 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEK2P51955 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEK2P51955 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEK2P51955 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEK2P51955 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEK2P51955 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NEK2P51955 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEK2P51955 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEK2P51955 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEK2P51955 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEK2P51955 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEK2P51955 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NEK2P51955 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEK2P51955 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEK2P51955 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEK2P51955 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEK2P51955 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEK2P51955 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NEK2P51955 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NEK2P51955 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEK2P51955 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEK2P51955 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEK2P51955 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEK2P51955 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEK2P51955 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEK2P51955 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NEK2P51955 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NEK2P51955 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEK2P51955 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEK2P51955 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NEK2P51955 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEK2P51955 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEK2P51955 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEK2P51955 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEK2P51955 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NEK2P51955 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEK2P51955 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEK2P51955 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NEK2P51955 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NEK2P51955 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms