Protein–RNA interactions for Protein: P51788

CLCN2, Chloride channel protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN2P51788 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLCN2P51788 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLCN2P51788 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLCN2P51788 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLCN2P51788 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLCN2P51788 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLCN2P51788 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLCN2P51788 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLCN2P51788 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLCN2P51788 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLCN2P51788 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLCN2P51788 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLCN2P51788 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLCN2P51788 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLCN2P51788 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLCN2P51788 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLCN2P51788 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLCN2P51788 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLCN2P51788 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLCN2P51788 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLCN2P51788 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLCN2P51788 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLCN2P51788 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLCN2P51788 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLCN2P51788 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLCN2P51788 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLCN2P51788 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLCN2P51788 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLCN2P51788 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLCN2P51788 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLCN2P51788 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLCN2P51788 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLCN2P51788 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLCN2P51788 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLCN2P51788 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLCN2P51788 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLCN2P51788 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLCN2P51788 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLCN2P51788 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLCN2P51788 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLCN2P51788 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLCN2P51788 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLCN2P51788 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLCN2P51788 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLCN2P51788 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLCN2P51788 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLCN2P51788 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLCN2P51788 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLCN2P51788 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLCN2P51788 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLCN2P51788 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLCN2P51788 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLCN2P51788 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLCN2P51788 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLCN2P51788 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLCN2P51788 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLCN2P51788 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CLCN2P51788 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLCN2P51788 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLCN2P51788 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CLCN2P51788 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLCN2P51788 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLCN2P51788 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLCN2P51788 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CLCN2P51788 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLCN2P51788 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLCN2P51788 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLCN2P51788 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CLCN2P51788 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CLCN2P51788 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLCN2P51788 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLCN2P51788 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLCN2P51788 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CLCN2P51788 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLCN2P51788 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLCN2P51788 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLCN2P51788 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLCN2P51788 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLCN2P51788 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLCN2P51788 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLCN2P51788 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CLCN2P51788 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLCN2P51788 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLCN2P51788 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLCN2P51788 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CLCN2P51788 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLCN2P51788 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CLCN2P51788 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLCN2P51788 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLCN2P51788 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLCN2P51788 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLCN2P51788 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLCN2P51788 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLCN2P51788 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLCN2P51788 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLCN2P51788 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLCN2P51788 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLCN2P51788 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLCN2P51788 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLCN2P51788 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms