Protein–RNA interactions for Protein: P51688

SGSH, N-sulphoglucosamine sulphohydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSHP51688 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SGSHP51688 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SGSHP51688 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SGSHP51688 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SGSHP51688 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SGSHP51688 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SGSHP51688 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SGSHP51688 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SGSHP51688 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SGSHP51688 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SGSHP51688 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SGSHP51688 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SGSHP51688 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SGSHP51688 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SGSHP51688 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SGSHP51688 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SGSHP51688 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SGSHP51688 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SGSHP51688 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SGSHP51688 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SGSHP51688 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SGSHP51688 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SGSHP51688 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SGSHP51688 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SGSHP51688 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SGSHP51688 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SGSHP51688 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SGSHP51688 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SGSHP51688 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SGSHP51688 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SGSHP51688 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SGSHP51688 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SGSHP51688 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SGSHP51688 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SGSHP51688 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SGSHP51688 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SGSHP51688 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SGSHP51688 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SGSHP51688 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SGSHP51688 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SGSHP51688 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SGSHP51688 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SGSHP51688 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SGSHP51688 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SGSHP51688 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SGSHP51688 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SGSHP51688 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SGSHP51688 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SGSHP51688 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SGSHP51688 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SGSHP51688 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SGSHP51688 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SGSHP51688 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SGSHP51688 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SGSHP51688 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SGSHP51688 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SGSHP51688 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SGSHP51688 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SGSHP51688 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SGSHP51688 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SGSHP51688 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SGSHP51688 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SGSHP51688 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SGSHP51688 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SGSHP51688 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SGSHP51688 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SGSHP51688 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SGSHP51688 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SGSHP51688 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SGSHP51688 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SGSHP51688 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SGSHP51688 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SGSHP51688 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SGSHP51688 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SGSHP51688 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SGSHP51688 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SGSHP51688 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SGSHP51688 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SGSHP51688 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SGSHP51688 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SGSHP51688 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SGSHP51688 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SGSHP51688 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SGSHP51688 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SGSHP51688 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SGSHP51688 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SGSHP51688 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SGSHP51688 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SGSHP51688 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SGSHP51688 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SGSHP51688 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SGSHP51688 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SGSHP51688 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SGSHP51688 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SGSHP51688 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SGSHP51688 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SGSHP51688 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SGSHP51688 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SGSHP51688 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SGSHP51688 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms