Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BRCA2P51587 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BRCA2P51587 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
BRCA2P51587 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
BRCA2P51587 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
BRCA2P51587 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BRCA2P51587 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
BRCA2P51587 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
BRCA2P51587 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
BRCA2P51587 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
BRCA2P51587 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
BRCA2P51587 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BRCA2P51587 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BRCA2P51587 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BRCA2P51587 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BRCA2P51587 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BRCA2P51587 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BRCA2P51587 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BRCA2P51587 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BRCA2P51587 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BRCA2P51587 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BRCA2P51587 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BRCA2P51587 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BRCA2P51587 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BRCA2P51587 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BRCA2P51587 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BRCA2P51587 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BRCA2P51587 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
BRCA2P51587 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BRCA2P51587 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
BRCA2P51587 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
BRCA2P51587 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BRCA2P51587 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BRCA2P51587 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRCA2P51587 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRCA2P51587 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRCA2P51587 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRCA2P51587 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRCA2P51587 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRCA2P51587 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BRCA2P51587 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
BRCA2P51587 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRCA2P51587 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRCA2P51587 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRCA2P51587 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRCA2P51587 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BRCA2P51587 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
BRCA2P51587 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
BRCA2P51587 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BRCA2P51587 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
BRCA2P51587 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
BRCA2P51587 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
BRCA2P51587 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
BRCA2P51587 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
BRCA2P51587 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
BRCA2P51587 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BRCA2P51587 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BRCA2P51587 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BRCA2P51587 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BRCA2P51587 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
BRCA2P51587 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BRCA2P51587 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
BRCA2P51587 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BRCA2P51587 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BRCA2P51587 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BRCA2P51587 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
BRCA2P51587 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
BRCA2P51587 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
BRCA2P51587 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
BRCA2P51587 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BRCA2P51587 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
BRCA2P51587 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
BRCA2P51587 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BRCA2P51587 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BRCA2P51587 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BRCA2P51587 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BRCA2P51587 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BRCA2P51587 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
BRCA2P51587 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
BRCA2P51587 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BRCA2P51587 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BRCA2P51587 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BRCA2P51587 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
BRCA2P51587 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
BRCA2P51587 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BRCA2P51587 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BRCA2P51587 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BRCA2P51587 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BRCA2P51587 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BRCA2P51587 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BRCA2P51587 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
BRCA2P51587 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BRCA2P51587 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BRCA2P51587 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BRCA2P51587 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
BRCA2P51587 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BRCA2P51587 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BRCA2P51587 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
BRCA2P51587 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRCA2P51587 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms