Protein–RNA interactions for Protein: P51449

RORC, Nuclear receptor ROR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORCP51449 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RORCP51449 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RORCP51449 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RORCP51449 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RORCP51449 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RORCP51449 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RORCP51449 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RORCP51449 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RORCP51449 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RORCP51449 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RORCP51449 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RORCP51449 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RORCP51449 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RORCP51449 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RORCP51449 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RORCP51449 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RORCP51449 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RORCP51449 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RORCP51449 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RORCP51449 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RORCP51449 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RORCP51449 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RORCP51449 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RORCP51449 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RORCP51449 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RORCP51449 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RORCP51449 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RORCP51449 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RORCP51449 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RORCP51449 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RORCP51449 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RORCP51449 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RORCP51449 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RORCP51449 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RORCP51449 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RORCP51449 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RORCP51449 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RORCP51449 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RORCP51449 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RORCP51449 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RORCP51449 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RORCP51449 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RORCP51449 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RORCP51449 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RORCP51449 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RORCP51449 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RORCP51449 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RORCP51449 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RORCP51449 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RORCP51449 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RORCP51449 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RORCP51449 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RORCP51449 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RORCP51449 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RORCP51449 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RORCP51449 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RORCP51449 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RORCP51449 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RORCP51449 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RORCP51449 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RORCP51449 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RORCP51449 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RORCP51449 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RORCP51449 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RORCP51449 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RORCP51449 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RORCP51449 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RORCP51449 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RORCP51449 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RORCP51449 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RORCP51449 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RORCP51449 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RORCP51449 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RORCP51449 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RORCP51449 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RORCP51449 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RORCP51449 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RORCP51449 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RORCP51449 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RORCP51449 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RORCP51449 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RORCP51449 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RORCP51449 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RORCP51449 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RORCP51449 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RORCP51449 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RORCP51449 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RORCP51449 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RORCP51449 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RORCP51449 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RORCP51449 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RORCP51449 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RORCP51449 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RORCP51449 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RORCP51449 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RORCP51449 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RORCP51449 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RORCP51449 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RORCP51449 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RORCP51449 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms