Protein–RNA interactions for Protein: P50607

TUB, Tubby protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBP50607 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TUBP50607 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TUBP50607 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TUBP50607 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TUBP50607 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TUBP50607 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TUBP50607 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TUBP50607 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TUBP50607 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TUBP50607 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TUBP50607 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TUBP50607 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TUBP50607 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TUBP50607 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TUBP50607 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TUBP50607 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TUBP50607 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TUBP50607 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TUBP50607 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TUBP50607 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TUBP50607 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TUBP50607 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TUBP50607 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TUBP50607 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TUBP50607 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TUBP50607 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TUBP50607 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TUBP50607 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TUBP50607 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TUBP50607 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TUBP50607 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TUBP50607 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TUBP50607 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TUBP50607 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TUBP50607 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TUBP50607 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TUBP50607 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TUBP50607 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TUBP50607 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TUBP50607 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TUBP50607 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TUBP50607 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TUBP50607 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TUBP50607 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TUBP50607 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TUBP50607 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TUBP50607 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TUBP50607 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TUBP50607 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TUBP50607 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TUBP50607 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TUBP50607 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TUBP50607 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TUBP50607 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TUBP50607 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TUBP50607 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TUBP50607 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TUBP50607 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TUBP50607 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TUBP50607 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TUBP50607 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TUBP50607 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TUBP50607 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TUBP50607 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TUBP50607 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TUBP50607 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TUBP50607 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TUBP50607 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TUBP50607 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TUBP50607 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
TUBP50607 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TUBP50607 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TUBP50607 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TUBP50607 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TUBP50607 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TUBP50607 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TUBP50607 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TUBP50607 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TUBP50607 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TUBP50607 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TUBP50607 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TUBP50607 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TUBP50607 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TUBP50607 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
TUBP50607 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TUBP50607 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TUBP50607 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TUBP50607 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TUBP50607 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TUBP50607 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TUBP50607 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TUBP50607 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TUBP50607 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TUBP50607 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TUBP50607 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
TUBP50607 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TUBP50607 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TUBP50607 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TUBP50607 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TUBP50607 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms