Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
PSEN1P49768 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PSEN1P49768 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PSEN1P49768 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PSEN1P49768 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PSEN1P49768 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PSEN1P49768 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PSEN1P49768 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PSEN1P49768 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PSEN1P49768 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PSEN1P49768 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PSEN1P49768 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSEN1P49768 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSEN1P49768 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSEN1P49768 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSEN1P49768 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PSEN1P49768 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PSEN1P49768 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PSEN1P49768 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PSEN1P49768 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSEN1P49768 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSEN1P49768 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSEN1P49768 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSEN1P49768 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSEN1P49768 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSEN1P49768 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PSEN1P49768 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PSEN1P49768 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PSEN1P49768 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PSEN1P49768 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PSEN1P49768 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PSEN1P49768 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PSEN1P49768 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PSEN1P49768 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PSEN1P49768 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSEN1P49768 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSEN1P49768 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSEN1P49768 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PSEN1P49768 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSEN1P49768 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSEN1P49768 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSEN1P49768 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSEN1P49768 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSEN1P49768 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSEN1P49768 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSEN1P49768 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSEN1P49768 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PSEN1P49768 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PSEN1P49768 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PSEN1P49768 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PSEN1P49768 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
PSEN1P49768 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSEN1P49768 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSEN1P49768 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSEN1P49768 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSEN1P49768 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PSEN1P49768 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PSEN1P49768 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSEN1P49768 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSEN1P49768 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSEN1P49768 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PSEN1P49768 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSEN1P49768 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSEN1P49768 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSEN1P49768 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PSEN1P49768 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
PSEN1P49768 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSEN1P49768 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSEN1P49768 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSEN1P49768 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSEN1P49768 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PSEN1P49768 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PSEN1P49768 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PSEN1P49768 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PSEN1P49768 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PSEN1P49768 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSEN1P49768 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSEN1P49768 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PSEN1P49768 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PSEN1P49768 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PSEN1P49768 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PSEN1P49768 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PSEN1P49768 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PSEN1P49768 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PSEN1P49768 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PSEN1P49768 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PSEN1P49768 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PSEN1P49768 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PSEN1P49768 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PSEN1P49768 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PSEN1P49768 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PSEN1P49768 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PSEN1P49768 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PSEN1P49768 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PSEN1P49768 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PSEN1P49768 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PSEN1P49768 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PSEN1P49768 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PSEN1P49768 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PSEN1P49768 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms