Protein–RNA interactions for Protein: P49238

CX3CR1, CX3C chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CX3CR1P49238 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CX3CR1P49238 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CX3CR1P49238 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CX3CR1P49238 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CX3CR1P49238 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CX3CR1P49238 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CX3CR1P49238 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CX3CR1P49238 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CX3CR1P49238 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CX3CR1P49238 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CX3CR1P49238 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CX3CR1P49238 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CX3CR1P49238 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CX3CR1P49238 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CX3CR1P49238 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CX3CR1P49238 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CX3CR1P49238 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CX3CR1P49238 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CX3CR1P49238 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CX3CR1P49238 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CX3CR1P49238 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CX3CR1P49238 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CX3CR1P49238 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CX3CR1P49238 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CX3CR1P49238 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CX3CR1P49238 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CX3CR1P49238 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CX3CR1P49238 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CX3CR1P49238 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CX3CR1P49238 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CX3CR1P49238 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CX3CR1P49238 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CX3CR1P49238 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CX3CR1P49238 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CX3CR1P49238 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CX3CR1P49238 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CX3CR1P49238 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CX3CR1P49238 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CX3CR1P49238 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CX3CR1P49238 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CX3CR1P49238 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CX3CR1P49238 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CX3CR1P49238 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CX3CR1P49238 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CX3CR1P49238 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CX3CR1P49238 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CX3CR1P49238 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CX3CR1P49238 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CX3CR1P49238 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CX3CR1P49238 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CX3CR1P49238 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CX3CR1P49238 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CX3CR1P49238 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CX3CR1P49238 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CX3CR1P49238 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CX3CR1P49238 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CX3CR1P49238 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CX3CR1P49238 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CX3CR1P49238 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CX3CR1P49238 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CX3CR1P49238 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CX3CR1P49238 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CX3CR1P49238 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CX3CR1P49238 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CX3CR1P49238 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CX3CR1P49238 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CX3CR1P49238 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CX3CR1P49238 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CX3CR1P49238 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CX3CR1P49238 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CX3CR1P49238 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CX3CR1P49238 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CX3CR1P49238 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CX3CR1P49238 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CX3CR1P49238 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CX3CR1P49238 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CX3CR1P49238 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CX3CR1P49238 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CX3CR1P49238 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CX3CR1P49238 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CX3CR1P49238 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CX3CR1P49238 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CX3CR1P49238 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CX3CR1P49238 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CX3CR1P49238 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CX3CR1P49238 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CX3CR1P49238 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CX3CR1P49238 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CX3CR1P49238 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CX3CR1P49238 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CX3CR1P49238 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CX3CR1P49238 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CX3CR1P49238 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CX3CR1P49238 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CX3CR1P49238 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CX3CR1P49238 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CX3CR1P49238 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CX3CR1P49238 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CX3CR1P49238 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CX3CR1P49238 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.9 ms