Protein–RNA interactions for Protein: P48552

NRIP1, Nuclear receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP1P48552 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NRIP1P48552 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
NRIP1P48552 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NRIP1P48552 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NRIP1P48552 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NRIP1P48552 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NRIP1P48552 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NRIP1P48552 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NRIP1P48552 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NRIP1P48552 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NRIP1P48552 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
NRIP1P48552 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NRIP1P48552 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NRIP1P48552 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NRIP1P48552 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NRIP1P48552 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NRIP1P48552 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NRIP1P48552 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NRIP1P48552 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NRIP1P48552 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NRIP1P48552 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NRIP1P48552 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NRIP1P48552 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NRIP1P48552 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NRIP1P48552 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NRIP1P48552 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NRIP1P48552 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NRIP1P48552 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NRIP1P48552 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NRIP1P48552 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NRIP1P48552 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NRIP1P48552 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
NRIP1P48552 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NRIP1P48552 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
NRIP1P48552 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NRIP1P48552 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NRIP1P48552 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NRIP1P48552 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NRIP1P48552 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NRIP1P48552 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NRIP1P48552 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NRIP1P48552 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NRIP1P48552 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NRIP1P48552 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NRIP1P48552 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NRIP1P48552 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NRIP1P48552 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NRIP1P48552 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NRIP1P48552 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NRIP1P48552 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
NRIP1P48552 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NRIP1P48552 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NRIP1P48552 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NRIP1P48552 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
NRIP1P48552 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NRIP1P48552 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NRIP1P48552 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NRIP1P48552 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NRIP1P48552 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NRIP1P48552 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NRIP1P48552 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NRIP1P48552 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NRIP1P48552 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NRIP1P48552 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NRIP1P48552 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NRIP1P48552 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NRIP1P48552 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NRIP1P48552 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NRIP1P48552 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NRIP1P48552 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NRIP1P48552 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NRIP1P48552 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NRIP1P48552 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NRIP1P48552 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NRIP1P48552 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NRIP1P48552 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NRIP1P48552 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NRIP1P48552 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NRIP1P48552 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NRIP1P48552 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NRIP1P48552 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NRIP1P48552 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NRIP1P48552 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NRIP1P48552 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NRIP1P48552 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NRIP1P48552 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NRIP1P48552 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NRIP1P48552 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NRIP1P48552 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NRIP1P48552 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NRIP1P48552 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NRIP1P48552 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NRIP1P48552 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
NRIP1P48552 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NRIP1P48552 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NRIP1P48552 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NRIP1P48552 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NRIP1P48552 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NRIP1P48552 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NRIP1P48552 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms