Protein–RNA interactions for Protein: P48066

SLC6A11, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A11P48066 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC6A11P48066 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC6A11P48066 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC6A11P48066 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC6A11P48066 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC6A11P48066 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC6A11P48066 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
SLC6A11P48066 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC6A11P48066 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC6A11P48066 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC6A11P48066 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC6A11P48066 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC6A11P48066 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC6A11P48066 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC6A11P48066 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC6A11P48066 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC6A11P48066 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC6A11P48066 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC6A11P48066 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC6A11P48066 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC6A11P48066 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC6A11P48066 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC6A11P48066 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC6A11P48066 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC6A11P48066 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC6A11P48066 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC6A11P48066 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC6A11P48066 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC6A11P48066 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC6A11P48066 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC6A11P48066 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC6A11P48066 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC6A11P48066 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC6A11P48066 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC6A11P48066 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC6A11P48066 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC6A11P48066 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC6A11P48066 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC6A11P48066 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC6A11P48066 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC6A11P48066 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC6A11P48066 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC6A11P48066 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC6A11P48066 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC6A11P48066 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC6A11P48066 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC6A11P48066 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC6A11P48066 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC6A11P48066 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC6A11P48066 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC6A11P48066 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC6A11P48066 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC6A11P48066 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC6A11P48066 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC6A11P48066 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC6A11P48066 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC6A11P48066 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC6A11P48066 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC6A11P48066 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC6A11P48066 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC6A11P48066 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC6A11P48066 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC6A11P48066 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC6A11P48066 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC6A11P48066 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC6A11P48066 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC6A11P48066 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC6A11P48066 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC6A11P48066 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC6A11P48066 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC6A11P48066 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC6A11P48066 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC6A11P48066 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC6A11P48066 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC6A11P48066 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC6A11P48066 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC6A11P48066 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC6A11P48066 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC6A11P48066 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC6A11P48066 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC6A11P48066 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC6A11P48066 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC6A11P48066 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SLC6A11P48066 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SLC6A11P48066 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC6A11P48066 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC6A11P48066 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC6A11P48066 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC6A11P48066 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC6A11P48066 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC6A11P48066 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC6A11P48066 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC6A11P48066 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC6A11P48066 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC6A11P48066 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC6A11P48066 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC6A11P48066 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC6A11P48066 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC6A11P48066 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC6A11P48066 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms